Supercómputo

foto laboratorio
La investigación en genómica genera un gran volúmen de datos que requieren de análsis complejos. Estos análisis utilizan una gran cantidad de cálculos para la obtención de información biológica relevante. Debido a esto es necesario el uso de tecnología de cómputo de alto rendimiento o “supercómputo”. El INMEGEN cuenta con una Unidad de Supercómputo en donde son procesados los datos obtenidos de los laboratorios y Unidades de Alta Tecnología. Esta unidad está conformada por un cluster con Linux que es capaz de realizar hasta 2,200,000,000,000 de operaciones de punto flotante por segundo. Este cluster consiste en 120 nodos o servidores con 2 procesadores AMD Opteron dual core a 2.0 Ghz con 5GB de memoria RAM. También se tienen 4 nodos especiales, tres de estos tienen 2 procesadores AMD Opteron quad core a 2.6 Ghz con 64GB de memoria RAM cada uno, y el cuarto nodo tiene un procesador PowerPC 570 de 16 cores con 128GB de memoria RAM. Se tiene un sistema de almacenamiento conformado por un arreglo de discos con tolerancia a fallas con capacidad de 15TB donde se almacenan los datos genómicos. Este sistema de almacenamiento pone estos datos a disposición de todos los nodos del cluster. Para respaldar la información contenida en el cluster, se cuenta con un sistema de respaldos que consiste en un robot de cintas con una capacidad de 120TB donde diariamente se respaldan todos los datos contenidos en el sistema de almacenamiento. Varias aplicaciones bioinformaticas para análisis de datos se ejecutan en el cluster uno de los análisis más relevantes fué el proyecto del Mapa del Genoma de Poblaciones Mexicanas mismo que se puede consultar en la siguiente liga http://diversity.inmegen.gob.mx.

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