Cursó la licenciatura en Ingeniería Química en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) donde también obtuvo el grado de Doctor en Ciencias en Fisicoquímica.

Actualmente es Investigador en Ciencias Médicas F, en el área de Genómica Computacional del INMEGEN y miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) Nivel III. Entre Abril de 2015 y Septiembre de 2019 fungió como Subdirector de Genómica Poblacional del INMEGEN.

En 2006 inició su labor en el Instituto en las líneas de investigación en Biología de Sistemas y Genómica Computacional y Análisis de Expresión, englobando proyectos dirigidos a entender de manera sistémica la regulación de la transcripción y la señalización en cáncer, entre otros temas. Estas líneas han tenido contribuciones importantes, tales como la predicción sistemática de mecanismos de resistencia a fármacos para tratar el cáncer de mama, develar mecanismos globales de acción de microRNAs relacionados a la plasticidad epitelio-mesenquimal en cáncer de mama, y mostrar que existe, al menos en cáncer de mama una pérdida de la regulación transcripcional intercromosomal.

Ha publicado más de 170 artículos de investigación en revistas internacionales y nacionales, 24 capítulos de libro y 4 libros. Muchos de los resultados de las líneas mencionados se han publicado en revistas del más alto impacto, tales como Proceedings of the National Academy of Sciences y Nature Communications y cuenta con más de 4500 citas. Es editor Asociado de las revistas Computational Biology and Chemistry y Computational and Systrems Oncology. También es editor de las revistas Scientific Reports, PLoS ONE, Frontiers in Oncology, Frontiers in Immunology, Frontiers in Physiology, Frontiers in Cell and Developmental Biology, Frontiers in Physics. Es uno de los miembros por latinoamérica del Consorcio Internacional The Human Cell Atlas. Ha dirigido 30 tesis (18 más en curso), que incluyen 9 de doctorado (5 más en curso), 11 de maestría (5 más en curso), y 6 de licenciatura (3 más en curso). Desde 1999 es profesor del Posgrado de la UNAM. Ha recibido diversos premios y distinciones, entre los que destaca la Cátedra Marcos Moshinsky en Ciencias Físicas 2016. Destaca también su participación como miembro del Consejo Académico del Centro de Ciencias de la Complejidad (C3) de la UNAM donde fue Coordinador del área de Inteligencia Computacional entre 2012 y 2022.

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http://orcid.org/0000-0002-1872-1397

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• Enrique Hernández Lemus. FENÓMENOS MULTIESCALA, COMPLEJIDAD Y FLUJOS DE INFORMACIÓN EN SISTEMAS BIOLÓGICOS. GARCÍA-COLÍN, L.S., DAGDUG, L., PICQUART, M. VÁZQUEZ, E.. La Física Biológica en México: Temas Selectos 2. EL COLEGIO NACIONAL; 2008. 45

• 2012 - Frontiers Research Foundation, Miembro del consejo editorial de la revista frontiers in membrane physiology and biophysics
• 2011 - Instituto Carlos Slim para la Salud / Instituto Broad (Harvard Univ. /M.I.T:), Becario de la iniciativa slim en medicina genómica
• 2011 - Scientific and Academic Publishing, USA, Miembro del consejo editorial de la revista international journal of biophysics
• 2009 - Centro de Investigación T.J. Watson, IBM, Investigador visitante en el centro de biología computacional de ibm

Diplomado

• Genética Estadística, CENTRO DE ESTUDIOS ARTURO ROSENBLUETH, S.C.

Doctorado

• Termoestadística de los materiales, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / INSTITUTO DE INVESTIGACIONES EN MATERIALES / DEPTO. DE MATERIALES METALICOS Y CERAMICOS

Licenciatura

• Bioinformática, INSTITUTO TECNOLÓGICO Y DE ESTUDIOS SUPERIORES DE MONTERREY / CAMPUS CIUDAD DE MÉXICO / DIVISION DE CIENCIAS DE LA SALUD / Ingeniero en Biotecnología
• Temas selectos de Biofísica y Física Médica I, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE CIENCIAS / DEPARTAMENTO DE FISICA
• Hidrodinámica, UNIVERSIDAD AUTONOMA DEL ESTADO DE MEXICO / FACULTAD DE CIENCIAS / DEPARTAMENTO DE FISICA
• Electromagnetismo, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA
• Cinemática y Dinámica, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA
• Termodinámica, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPTO. DE FISICO-QUIMICA

Maestria

• Aplicaciones Pediátricas de la Medicina Genómica (Biología de Sistemas), UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
• Introducción a la Medicina Genómica (Introducción a la Biología de Sistemas), UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
• Matemáticas Avanzadas I, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA
• Prerrequisitos de Matemáticas (Maestría en Ciencias Químicas) (Fisicoquímica), UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA
• Fundamentos físicos de la fisicoquímica superior I, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA

Público en General

• MÉTODO ESTADÍSTICO REVELA AUTORÍA, Medios Impresos, Periódico Milenio. 2006-08-11
• Emmanuel Matta es Carlos Fuentes, Medios Impresos, Periódico Milenio. 2006-08-10

Tesista de Doctorado

• Alejandra Paulina Pérez González
• Helena Reyes Gopar
• José Joel Ruíz Hernández
• Luis Fernando Díaz Martínez
• Martín Ruhle
• Paola Elena García Vázquez

Tesista de Maestría

• Marco Antonio Pita Galeana
• Miguel Ángel Díaz Campos
• Miguel Atl Silva Magaña

Tesista de Licenciatura

• Alejandro Bárcenas Femat
• Francisco Emiliano Jiménez Zamora

Servicio Social

• Brenda del Carmen Dávila Quiñonez
• Diana Laura Prado Resendiz
• Diana Laura Venancio Tolentino
• Jesús Mauricio Flores Cruz
• María de Lourdes Gallardo Ortíz
• María del Rosario Campos González
• María Guadalupe Popoca Medina
• Nancy San Martín Rumualdo
• Vania Yamile Nava Linares

Práctica Profesional

• Allan Ken Miyazono Ushijima
• Danae Alejandra Cortés García
• Emilio Sosa Díaz

Estancia Voluntaria

• Claudia Chávez López
• Fryda Fernanda Solis Roldan
• Gerardo Cendejas Mendoza
• Héctor Alejandro Cruz Ávila
• Jorge Benjamín Arroyo Casillas
• Jorge Luis Gómez Hernández

• Maestría en ciencias químicas (fisicoquímica), UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA (None)
• Doctor en ciencias químicas, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA (2006-10-05)
• Ingeniero químico, Universidad Nacional Autonoma De Mexico / Coordinacion De Investigacion Cientifica / Facultad De Estudios Superiores Zaragoza / Division De Ciencias Quimico-Biologicas (1995-04-14)

• Español
• Francés
• Italiano
• Inglés
• Alemán

• Karol Baca López Enrique Hernández Lemus Miguel Mayorga Rojas. FÍSICA BIOLÓGICA Y REGULACIÓN TRANSCRIPCIONAL EN CÁNCER. . EDITORIAL ACADÉMICA ESPAÑOLA; 2012. 10809; [ISBN: ISBN: 978-3-659-00492-6]

En curso

• Análisis dinámico de la robustez y adaptabilidad del microbioma humano y sus implicaciones en enfermedades gastrointestinales y metabólicas
• Entendimiento sistémico del papel funcional de los micro-RNAs en subtipos moleculares de cáncer de mama
• EVALUACIÓN INTEGRAL DE LA REGULACIÓN GENÓMICA Y EPIGENÓMICA EN CÁNCER DE MAMA
• Herramientas OMICAS para el estudio de sistemas ateroscleróticos
• Panel microbiológico de riesgo de parto pretérmino guiado por inteligencia computacional

Terminados

• Análisis e implementación de algoritmos como herramientas computacionales para el mapeo de datos de secuenciación masiva de applied biosystems solid a un genoma de referencia para aplicaciones a genómica funcional
• Búsqueda de vías de señalización con eventos de entrecruzamiento susceptibles a modulación en Cáncer Primario de Mama
• Caracterización de variabilidad genética en población indígena mexicana (100G-MX)
• Estudio integral del transcriptoma, proteoma y metiloma de las células del cáncer de hígado
• Identificación sin falsos positivos de microRNAs de células en cultivo
• Redes transcripcionales implicadas en la diferenciación y el desarrollo de los Sistemas Biológicos: La raíz de Arabidopsis thaliana y células tumorales humanas como modelos de estudio
• Termodinámica fuera de equilibrio y análisis de redes complejas en la regulación genética mediada por factores de transcripción maestros

Doctorado

• Alexandra Delgado Gonzalez. Desnaturalización de ADN en suspensiones e interacciones de depleción en sistemas coloide-membrana. UNIVERSIDAD DE GUANAJUATO / CAMPUS LEÓN / DIVISIÓN DE CIENCIAS E INGENIERÍAS / DEPARTAMENTO DE INGENIERÍA FÍSICA.

Licenciatura

• María Dolores Correa Rodríguez. Transporte no-lineal y memoria en procesos de regulación transcripcional. UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / FACULTAD DE CIENCIAS.
• Luz Adriana Nicasio Collazo. Termodinámica irreversible de la histéresis en la desnaturalización del ADN. UNIVERSIDAD DE GUANAJUATO / CAMPUS LEÓN / DIVISIÓN DE CIENCIAS E INGENIERÍAS / DEPARTAMENTO DE FÍSICA.
• Brenda Cantú Bolán. Coherencia y caracter linguistico en secuencias de ADN no codificante. UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE CIENCIAS / DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA.

Maestria

• Luz Adriana Nicasio Colazo. Procesos irreversibles en la desnaturalización de ADN en suspensiones. UNIVERSIDAD DE GUANAJUATO / CAMPUS LEÓN / DIVISIÓN DE CIENCIAS E INGENIERÍAS / DEPARTAMENTO DE INGENIERÍA FÍSICA.
• Karol Baca López. Física biológica y modelado probabilístico de la regulación transcripcional en cáncer de mama. UNIVERSIDAD AUTONOMA DEL ESTADO DE MEXICO / FACULTAD DE CIENCIAS / DEPARTAMENTO DE FISICA.

• INVESTIGADOR EN CIENCIAS MÉDICAS "B", INSTITUTO NACIONAL DE MEDICINA GENÓMICA (None)
• PROFESOR DE ASIGNATURA, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE QUÍMICA / DEPARTAMENTO DE FISICA Y QUIMICA TEORICA (2002-01-30)