Este fue creado en el 2012, bajo el liderazgo del Dr. Juan Pablo Reyes Grajeda, con la visión de desarrollar e implementar las aproximaciones proteómicas para la búsqueda de biomarcadores, así como la de identificar potenciales blancos terapéuticos mediante el uso de tecnologías ómicas. De ahí que sus principales líneas de investigación sean la proteómica y la genómica de enfermedades cardiovasculares. Otros proyectos de investigación comprenden la búsqueda de biomarcadores serológicos proteómicos para el diagnóstico de glaucoma primario de ángulo abierto, la caracterización del perfil proteómico y de citocinas en sueros de pacientes infectados con el virus de la influenza AH1N1 pandémica, el estudio de sistemas ateroscleróticos y la implementación de un panel de metodologías analíticas para demostrar la biocompatibilidad de medicamentos biotecnológicos, específicamente en el caso de la insulina glargina. El laboratorio ha conseguido describir los perfiles transcriptómicos del músculo liso vascular en procesos de endocitosis de lipoproteínas de baja densidad como modelo temprano de aterosclerosis, publicado en la revista Plos One, así como el diseño de una vacuna multiepitípica en contra de la Escherichia coli uropatogénica, publicado en Frontiers in Cellular and Infection Microbiology en el mismo año.