Curriculum Vitae

Dra. Claudia Rangel Escareño

Dra. Claudia Rangel Escareño

Investigador en Ciencias Médicas E
5350-1900 ext.1976
crangel@inmegen.gob.mx

Cursó la licenciatura en Matemáticas en la Universidad Autónoma Metropolitana; obtuvo el grado de Maestría en Matemáticas y el Doctorado en Ciencias Matemáticas en Claremont Graduate University, California EUA. Tiene experiencia de tres años de estancia posdoctoral en University of Southern California, USA. Actualmente es Investigadora en Ciencias Médicas “D”, titular de laboratorio en el INMEGEN y miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) Nivel 2.

En 2006 inició o colabora en diversas líneas de investigación en el INMEGEN y otro número importante con otros institutos nacionales de salud, así como universidades y centro de investigación nacionales e internacionales y principalmente en la línea de Genómica de las enfermedades infecciosas, estudiando la asociación estructural Huesped-Parásito en Leishmania Mexicana; o en modelos probabilistas estudiando aquéllos basados en redes Bayesianas dina?micas para inferir la regulacio?n de microRNAs y mensajero en respuesta a un estímulo, englobando proyectos dirigidos a investigación genómica computacional y análisis de expresión, Genómica de enfermedades infecciosas y Biología de Sistemas, entre otros temas. Esta línea ha tenido contribuciones importantes, tales como tesis de doctorado, publicaciones y divulgación en congresos científicos.

Ha publicado 42 artículos de investigación en revistas internacionales y 4 capítulos de libro. Muchos de los resultados de las líneas mencionados se han publicado en revistas del más alto impacto, tales como Nature, Science, PNAS y cuenta con cerca de 4000 citas. Ha dirigido 9 de tesis, que incluyen 3 de doctorado, 2 de maestría, 1 de especialidad y 3 de licenciatura. Tiene una patente internacional sometida en 2012 y respaldada por una de las publicaciones de la revista Nature. Desde 2003 es profesora del Posgrado en Matemáticas, Doctorado en Ingeniería y Doctorado en Ciencias Computacionales de Claremont Graduate University, desde 2010 también en San Diego State University y desde 2014 también en el Tecnológico de Monterrey CCM. Ha recibido 2 premios y distinciones. Destaca su participación como invitado en diversas reuniones científicas y de divulgación.

Artículos

  • Hernandez-Lemus E., Rangel-Escareño C.. THE ROLE OF INFORMATION THEORY IN GENE REGULATORY NETWORK INFERENCE. P. DELOUMEAUX ET AL. Information Theory: New Research. NOVA SCIENCE; 2011.
  • John Angus, Matthew J. Beal, Juan Li, Claudia Rangel and David L. Wild (NOTA: Autores en orden alfabético) ISBN 978-0-262-01386-4. INFERRING TRANSCRIPTIONAL NETWORKS USING PRIOR BIOLOGICAL KNOWLEDGE AND CONSTRAINED STATE SPACE MODELS. NEIL D. LAWRENCE, MARK GIROLAMI, MAGNUS RATTRAY, GUIDO SANG. Learning and Inference in Computational Systems Biology. THE MIT PRESS (IN PRESS); 2010. 366
  • Claudia Rangel, John Angus, Zoubin Ghahramani, and David Wild. MODELING BIOLOGICAL RESPONSES USING GENE EXPRESSION PROFILING AND STATE SPACE MODELS. SPRINGER VERLAG. Applications of Probabilistic Modelling in Medical Informatics and Bioinformatics. SPRINGER VERLAG; 2003.
  • 2011 - Instituto Carlos Slim de la Salud, Beca carlos slim para estancias de capacitación en genómica en el extranjero
  • 2010 - Instituto Carlos Slim de la Salud, Beca carlos slim para estancias de capacitación en genómica en el extranjero
  • 2006 - INMEGEN, Beca para ii congreso de medicina genómica
  • 2002 - PHI BETA KAPPA ALUMNI IN SOUTHERN CALIFORNIA, Scholarship
  • 2002 - SAN DIEGO STATE UNIVERSITY, First pan-american advanced studies institute felllowship
  • 2001 - INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, Recomb travel fellowship

Diplomado

  • Introducción al análisis de datos genómicos, FUNDACION ARTURO ROSENBLUETH, A.C.

Doctorado

  • MATh365 Computational Methods for Molecular Biology, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
  • Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
  • Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
  • Math364 Introduction to Scientific Computing, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
  • MATH 364: Introduction to Scientific Computing, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY

Especialidad

  • Bases de la Genómica Computacional, INSTITUTO NACIONAL DE MEDICINA GENÓMICA
  • Genómica Computacional, INSTITUTO NACIONAL DE MEDICINA GENÓMICA

Maestria

  • Introducción a la Medicina Genómica/ Cátedra: Herramientas computacionales en expresión genómica, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
  • Aplicaciones Genómicas en Medicina Interna/Cátedra:Herramientas Computacionales en Expresión Genómic, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
  • Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY

Estudiantes

  • MULTIDIMENSIONAL DATA AND INTEGRATIVE GENOMICS, Conferencias, PASI: Panamerican Advanced Studies Institute, Facultad de Estadística e Informática, Universidad Veracruzana, Xalapa, Veracruz. 2011-08-11
  • IMPORTANT ASPECTS IN DESIGN AND STATISTICAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION DATA, Conferencias, PASI: Panamerican Advanced Studies Institute, Facultad de Estadística e Informática, Universidad Veracruzana, Xalapa, Veracruz. 2011-08-11
  • IMPLEMENTACIÓN DE UN MODELO DE ESPACIO-ESTADO PARA INFERIR LA DINÁMICA DE REGULACIÓN DE GENES, Conferencias, FES ACATLÁN. 2009-03-25
  • Aplicaciones Matemáticas en el Estudio del Genoma Humano, Conferencias, Instituto Tecnológico Autónomo de México ITAM. 2006-09-08

Público en General

  • CLASSICAL AND BAYESIAN APPROACHES TO RECONSTRUCTING GENETIC REGULATORY NETWORKS, Conferencias, 12th International Conference on Intelligent Systems and Molecular Biology ISMB 2004. 2004-07-28

Sector Académico

  • COMPREHENSIVE OVERVIEW OF INTRINSIC BREAST CANCER SUBTYPES IN MEXICAN AND VIETNAMESE POPULATIONS, Seminarios, Warwick Sistems Biology Centre Seminar, University of Warwick. 2011-07-11
  • ALGORITMOS DE ALINEAMIENTO GLOBAL Y LOCAL EN SECUENCIACIÓN MASIVA (PONENTE INVITADO), Conferencias, Centro de Ciencias Genomicas. 2010-08-02
  • NUEVAS APLICACIONES MATEMÁTICAS Y FÍSICAS: GENÓMICA, BIOLOGÍA MOLECULAR, BIOINFORMÁTICA Y MEDICINA, Talleres, Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Campus Cd. de México. 2010-07-26
  • LEARNING AND INFERENCE IN COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOLOGY (PONENTE INVITADO), Conferencias, CIMAT & RICE UNIVERSITY. 2010-05-05
  • APPLICATION OF DI-BASE SEQUENCING TO SNPS DETECTION IN THE AB SOLIDTM SYSTEM, Conferencias, CIMAT and RICE UNIVERSITY. 2010-05-04
  • LA ESTADÍSTICA EN EL ESTUDIO DEL GENOMA HUMANO, Conferencias, Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey. 2010-03-25
  • MÉTODOS ESTADÍSTICOS Y ANALÍTICOS DE DATOS GENÓMICOS, Talleres, IBT - UNAM. 2010-01-18
  • DYNAMIC MODELING OF GENE EXPRESSION DATA, Conferencias, Centro de Investigación en Matemáticas CIMAT. 2008-02-23
  • Second Annual Center for Excellence in Genomic Science Research Symposium, Simposium, University of Southern California - Computational and Molecular Biology Department. 2006-04-08
  • POSTER PRESENTATION, Simposium, 1st Southern California Applied Mathematics Symposium SoCAMS. 2001-05-12
UNIVERSIDAD DE CALIFORNIA SAN DIEGO. 2004-06-25
Universidad Del Sur De California. 2003-09-15
  • Postdoctoral research associate, Universidad Del Sur De California (2006-05-31)
  • Matematico, Universidad Autonoma Metropolitana / Unidad Iztapalapa / Division De Ciencias Basicas E Ingenieria (Cbi) / Departamento De Matematicas (1991-04-19)

En curso

Terminados

  • Análisis de cambios en la expresión génica inducidos por LPG de Leishamaniasis en células NK de pacientes con Leishmaniasis cutánea localizada y difusa
  • Análisis de expresión de microRNAs en suero de mujeres postmenopáusicas: búsqueda de biomarcadores no invasivos del metabolismo óseo para el diagnóstico de la osteoporosis
  • Análisis e implementación de algoritmos como herramientas computacionales para el mapeo de datos de secuenciación masiva de applied biosystems solid a un genoma de referencia para aplicaciones a genómica funcional
  • Efecto de la proteína dieteria sobre la expresión de enzimas degradadoras de aminoácidos mediada por PPAR?
  • Estudio del epigenoma en pacientes adolescentes y adultos con intento de suicidio y suicidio consumado
  • Evaluación y validación precomercial de una plataforma bioinformática para el análisis de datos genómicos
  • Genómica funcional en la germinación del Maíz mecanismos de control traduccional
  • Identificación de biomarcadores asociados a la variación de la Densidad Mineral Ósea mediante análisis de miRNAs en monocitos circulantes de sangre periférica en mujeres postmenopáusicas mexicanas.
  • Identificación de las variables genéticas comunes asociadas a enfermedades psiquiátricas en población mexicana mediante un microarreglo consensado para el diseño de un perfil de diagnóstico molecular
  • Identificación de microRNAs involucrados en la diferenciación de monocitos a osteoclastos y su papel en la variación de la densidad mineral Ósea.
  • Identificación de variantes funcionales en genes candidato asociados con el riesgo al desarrollo de síndrome metabólico en grupos indígenas y población mestiza mexicana
  • Metagenómica de enfermedades infecciosas emergentes y reemergentes transmitidas por artrópodos de la zona del Golfo de México
  • Modelo basado en redes Bayesianas dinámicas para inferir la regulación de microRNAs y mensajero en respuesta a andrógenos en cáncer

Licenciatura

  • Ivan Imaz Rosshandler. Análisis comparativo de algoritmos de normalización en datos de microarreglos de alta densidad. UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO.
  • Erika Lagos Suarez. Selección de características principales en datos de expresión de microarreglos mediante método de Monte Carlo. INSTITUTO TECNOLOGICO AUTONOMO DE MEXICO / DIVISION ACADEMICA DE ACTUARIA ESTADISTICA Y MATEMATICAS / DEPARTAMENTO DE MATEMATICAS.

Maestria

  • Daniel Ortega Bernal. Desarrollo de un meta-análisis de datos complejos en Biología computacional. UNIVERSIDAD AUTONOMA DE LA CIUDAD DE MEXICO / DEL VALLE UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE LA CIUDAD DE MÉXICO.

Ha colaborado en proyectos y/o publicaciones con:

M. en C. Juan Carlos Fernández López
Número de colaboraciones: 8
Mat. Iván Imaz Rosshandler
Mat. Iván Imaz Rosshandler
Número de colaboraciones: 8
Dr. Enrique Hernández Lemus
Número de colaboraciones: 5
Dr. Gerardo Jimenez Sánchez
Dr. Gerardo Jimenez Sánchez
Número de colaboraciones: 4
Ing. Rodrigo Garcia Herrera
Ing. Rodrigo Garcia Herrera
Número de colaboraciones: 4

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