Curriculum Vitae
Dra. Claudia Rangel Escareño
Investigador en Ciencias Médicas E
Cursó la licenciatura en Matemáticas en la Universidad Autónoma Metropolitana; obtuvo el grado de Maestría en Matemáticas y el Doctorado en Ciencias Matemáticas en Claremont Graduate University, California EUA. Tiene experiencia de tres años de estancia posdoctoral en University of Southern California, USA. Actualmente es Investigadora en Ciencias Médicas “D”, titular de laboratorio en el INMEGEN y miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) Nivel 2.
En 2006 inició o colabora en diversas líneas de investigación en el INMEGEN y otro número importante con otros institutos nacionales de salud, así como universidades y centro de investigación nacionales e internacionales y principalmente en la línea de Genómica de las enfermedades infecciosas, estudiando la asociación estructural Huesped-Parásito en Leishmania Mexicana; o en modelos probabilistas estudiando aquéllos basados en redes Bayesianas dina?micas para inferir la regulacio?n de microRNAs y mensajero en respuesta a un estímulo, englobando proyectos dirigidos a investigación genómica computacional y análisis de expresión, Genómica de enfermedades infecciosas y Biología de Sistemas, entre otros temas. Esta línea ha tenido contribuciones importantes, tales como tesis de doctorado, publicaciones y divulgación en congresos científicos.
Ha publicado 42 artículos de investigación en revistas internacionales y 4 capítulos de libro. Muchos de los resultados de las líneas mencionados se han publicado en revistas del más alto impacto, tales como Nature, Science, PNAS y cuenta con cerca de 4000 citas. Ha dirigido 9 de tesis, que incluyen 3 de doctorado, 2 de maestría, 1 de especialidad y 3 de licenciatura. Tiene una patente internacional sometida en 2012 y respaldada por una de las publicaciones de la revista Nature. Desde 2003 es profesora del Posgrado en Matemáticas, Doctorado en Ingeniería y Doctorado en Ciencias Computacionales de Claremont Graduate University, desde 2010 también en San Diego State University y desde 2014 también en el Tecnológico de Monterrey CCM. Ha recibido 2 premios y distinciones. Destaca su participación como invitado en diversas reuniones científicas y de divulgación.
Artículos
-
Montes de Oca-Aguilar AC, Fernandez-Figueroa EA, Lopez-Avila KB, Pavon-Mendez MI, Sosa-Bibiano EI, Rebollar-Tellez EA, Palacio-Vargas JA, Garcia-Lopez B, Rangel-Escareno C, Loria-Cervera EN. Abundance and Leishmania infection patterns of the sand fly Psathyromyia cratifer in Southern Mexico. PLoS Negl Trop Dis. 2024 Sep 10; 18(9):e0012426.
-
Ramirez-Rosete JA, Hurtado-Vazquez A, Miranda-Duarte A, Peralta-Cruz S, Cuevas-Olivo R, Martinez-Junco JA, Sevilla-Montoya R, Rivera-Paredez B, Velazquez-Cruz R, Valdes-Flores M, Rangel-Escareno C, Alanis-Funes GJ, Abad-Azpetia L, Grimaldo-Galeana SG, Santamaria-Olmedo MG, Hidalgo-Bravo A. Environmental and Genetic Risk Factors in Developmental Dysplasia of the Hip for Early Detection of the Affected Population. Diagnostics (Basel). 2024 Apr 25; 14(9):None.
-
Ortiz Valdez E, Rangel-Escareno C, Matus Santos JA, Vazquez Romo R, Guijosa A, Villarreal-Garza C, Arrieta O, Rodriguez-Bautista R, Caro-Sanchez CH, Ortega Gomez A. Characterization of triple negative breast cancer gene expression profiles in Mexican patients. Mol Clin Oncol. 2023 Jan; 18(1):5.
-
Espinal-Enriquez J, Rangel-Escareno C, Emmert-Streib F. Editorial: Cancer systems biology. Front Genet. 2022 NOV 18; 13:None.
-
Halabi S, Luo B, Dzimitrowicz H, Hwang C, Wise-Draper TM, Labaki C, Mckay RR, Ruiz E, Rangel-Escareno C, Farmakiotis D, Griffiths EA, Jani CT, Accordino M, Friese C, Wulff-Burchfield E, Puc M, Yu P, Topaloglu U, Mishra S, Warner J. A prognostic model of all-cause mortality at 30 days in patients with cancer and COVID-19. Ann Oncol. 2022 SEP; 33(7):S771 - S772.
-
Alanis-Funes GJ, Lira-Albarran S, Hernandez-Perez J, Garza-Elizondo MA, Ortiz-Lopez R, Elizondo CV, Rojas-Martinez A, Chavez-Santoscoy RA, Rangel-Escareno C. Genomic Characterization by Whole-Exome Sequencing of Hypermobility Spectrum Disorder. Genes (Basel). 2022 Jul 18; 13(7):.
-
Trejo-Castro AI, Carrion-Alvarez D, Martinez-Torteya A, Rangel-Escareno C. A Bibliometric Review on Gut Microbiome and Alzheimer's Disease Between 2012 and 2021. Am J Med Genet. 2022 JUL 11; 14:None.
-
Cadena-Suarez AR, Hernandez-Hernandez HA, Alvarado-Vasquez N, Rangel-Escareno C, Sommer B, Negrete-Garcia MC. Role of MicroRNAs in Signaling Pathways Associated with the Pathogenesis of Idiopathic Pulmonary Fibrosis: A Focus on Epithelial-Mesenchymal Transition. Int J Mol Sci. 2022 Jun 14; 23(12):None.
-
Sosa-Bibiano EI, Sanchez-Martinez LA, Lopez-Avila KB, Chable-Santos JB, Torres-Castro JR, Fernandez-Figueroa EA, Rangel-Escareno C, Loria-Cervera EN. Leishmania (Leishmania) mexicana Infection in Wild Rodents from an Emergent Focus of Cutaneous Leishmaniasis in Yucatan, Mexico. J Trop Med. 2022; 2022:8392005.
-
Rodriguez-Bautista R, Caro-Sanchez CH, Cabrera-Galeana P, Alanis-Funes GJ, Gutierrez-Millan E, Avila-Rios S, Matias-Florentino M, Reyes-Teran G, Diaz-Chavez J, Villarreal-Garza C, Hernandez-Pedro NY, Ortega-Gomez A, Lara-Mejia L, Rangel-Escareno C, Arrieta O. Immune Milieu and Genomic Alterations Set the Triple-Negative Breast Cancer Immunomodulatory Subtype Tumor Behavior. Cancers (Basel). 2021 Dec 13; 13(24):None.
-
Granados-Montiel J, Cruz-Lemini M, Rangel-Escareno C, Martinez-Nava G, Landa-Solis C, Gomez-Garcia R, Lopez-Reyes A, Espinosa-Gutierrez A, Ibarra C. SERPINA9 and SERPINB2: Novel Cartilage Lineage Differentiation Markers of Human Mesenchymal Stem Cells with Kartogenin. Cartilage. 2021 Oct 29; 1:1947603518809403.
-
Romero-Pimentel AL, Almeida D, Munoz-Montero S, Rangel C, Mendoza-Morales R, Gonzalez-Saenz EE, Nagy C, Chen G, Aouabed Z, Theroux JF, Turecki G, Martinez-Levy G, Walss-Bass C, Monroy-Jaramillo N, Fernandez-Figueroa EA, Gomez-Cotero A, Garcia-Dolores F, Morales-Marin ME, Nicolini H. Integrative DNA Methylation and Gene Expression Analysis in the Prefrontal Cortex of Mexicans who died by Suicide. Int J Neuropsychopharmacol. 2021 Jul 2; :.
-
Sanchez-Montes S, Blum-Dominguez S, Lozano-Sardaneta YN, Zazueta-Islas HM, Solis-Cortes M, Ovando-Marquez O, Colunga-Salas P, Tamay-Segovia P, Becker I, Fernandez-Figueroa E, Rangel-Escareno C. Molecular detection of Rickettsia sp. cf. Rickettsia monacensis in Ixodes sp. cf. Ixodes affinis collected from white-tailed deer in Campeche, Mexico. Parasitol Res. 2021 May; 120(5):1891-1895.
-
Garcia-Olivares M, Romero-Cordoba S, Ortiz-Sanchez E, Garcia-Becerra R, Segovia-Mendoza M, Rangel-Escareno C, Halhali A, Larrea F, Barrera D. Regulation of anti-tumorigenic pathways by the combinatory treatment of calcitriol and TGF-beta in PC-3 and DU145 cells. J Steroid Biochem Mol Biol. 2021 May; 209:105831.
-
Azotla-Vilchis CN, Sanchez-Celis D, Agonizantes-Juarez LE, Suarez-Sanchez R, Hernandez-Hernandez JM, Pena J, Vazquez-Santillan K, Leyva-Garcia N, Ortega A, Maldonado V, Rangel C, Magana JJ, Cisneros B, Hernandez-Hernandez O. Transcriptome Analysis Reveals Altered Inflammatory Pathway in an Inducible Glial Cell Model of Myotonic Dystrophy Type 1. Biomolecules. 2021 Jan 26; 11(2):.
-
Alcaraz-Lopez OA, Villarreal-Morales Y, Rangel-Escareno C, Gutierrez-Pabello JA. Assessment of candidate biomarkers to detect resistance to Mycobacterium bovis in Holstein-Friesian cattle. Res Vet Sci. 2020 Jul 31; 132:416-425.
-
Ceccarelli M, Diotallevi A, Buffi G, De Santi M, Fernandez-Figueroa EA, Rangel-Escareno C, Munoz-Montero SA, Becker I, Magnani M, Galluzzi L. Differentiation of Leishmania (L.) infantum, Leishmania (L.) amazonensis and Leishmania (L.) mexicana Using Sequential qPCR Assays and High-Resolution Melt Analysis. Microorganisms. 2020 May 29; 8(6):.
-
Sanchez-Montes S, Fernandez-Figueroa E, Gonzalez-Guzman S, Cervantes VP, Ballados-Gonzalez GG, Rangel-Escareno C, Cardenas-Ovando RA, Becker I. New records of Haemaphysalis leporispalustris in the Transmexican Volcanic Belt province of Mexico with detection of rickettsial infection. Parasitol Res. 2020 Jun; 119(6):1969-1973.
-
Caballero-Campo P, Lira-Albarran S, Barrera D, Borja-Cacho E, Godoy-Morales HS, Rangel-Escareno C, Larrea F, Chirinos M. Gene transcription profiling of astheno- and normo-zoospermic sperm subpopulations. Asian J Androl. 2020 Feb 14; :.
-
Lozano-Sardaneta YN, Sanchez-Montes S, Fernandez-Figueroa E, Rangel-Escareno C, Becker I. Molecular identification of Dermatobia hominis (Diptera: Oestridae): a neglected agent causing myiasis in Mexico. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2020; 62:e47.
-
Morales-Guerrero SE, Rivas-Ortiz CI, Ponce de Leon-Rosales S, Gamboa-Dominguez A, Rangel-Escareno C, Uscanga-Dominguez LF, Aguilar-Gutierrez GR, Kershenobich-Stalnikowitz D, Castillo-Rojas G, Lopez-Vidal Y. Translation of gastric disease progression at gene level expression. J Cancer. 2020; 11(2):520-532.
-
de Oyarzabal E, Garcia-Garcia L, Rangel-Escareno C, Ferreyra-Reyes L, Orozco L, Herrera MT, Carranza C, Sada E, Juarez E, Ponce-de-Leon A, Sifuentes-Osornio J, Wilkinson RJ, Torres M. Expression of USP18 and IL2RA Is Increased in Individuals Receiving Latent Tuberculosis Treatment with Isoniazid. J Immunol Res. 2019; 2019:1297131.
-
Sanchez-Montes S, Ballados-Gonzalez GG, Hernandez-Velasco A, Zazueta-Islas HM, Solis-Cortes M, Miranda-Ortiz H, Canseco-Mendez JC, Fernandez-Figueroa EA, Colunga-Salas P, Lopez-Perez AM, Delgado-de la Mora J, Licona-Enriquez JD, Delgado-de la Mora D, Karpathy SE, Paddock CD, Rangel-Escareno C. Molecular Confirmation of Rickettsia parkeri in Amblyomma ovale Ticks, Veracruz, Mexico. Emerg Infect Dis. 2019 Dec; 25(12):2315-2317.
-
Cardenas-Ovando RA, Fernandez-Figueroa EA, Rueda-Zarate HA, Noguez J, Rangel-Escareno C. A feature selection strategy for gene expression time series experiments with hidden Markov models. PLoS One. 2019; 14(10):e0223183.
-
Arenas P, Gil-Alarcon G, Sanchez-Montes S, Soto-Trujillo MP, Fernandez-Figueroa E, Rangel-Escareno C. Molecular detection of Bartonella, Ehrlichia and Mycoplasma in feral dogs of El Pedregal de San Angel Ecological Reserve in Mexico City. Rev Bras Parasitol Vet. 2019 Oct-Dec; 28(4):728-734.
-
MacDonald-Ramos K, Arenas-Hernandez M, Mancilla-Herrera I, Rangel-Escareno C, Vega-Sanchez R. A trypsin-based method for isolating leukocytes from human choriodecidua suitable for immunophenotyping and transcriptome studies. Immunobiology. 2019 Sep 22; 1:.
-
Barajas-Olmos FM, Ortiz-Sanchez E, Imaz-Rosshandler I, Cordova-Alarcon EJ, Martinez-Tovar A, Villanueva-Toledo J, Morales-Marin ME, Cruz-Colin JL, Rangel C, Orozco L, Centeno F. Analysis of the dynamic aberrant landscape of DNA methylation and gene expression during arsenic-induced cell transformation. Gene. 2019 Aug 30; 711:143941.
-
Lira-Albarran S, Vega CC, Durand M, Rangel C, Larrea F. Functional genomic analysis of the human receptive endometrium transcriptome upon administration of mifepristone at the time of follicle rupture. Mol Cell Endocrinol. 2019 Apr 5; 485:88-96.
-
Negrete-Garcia MC, Ramirez-Rodriguez SL, Rangel-Escareno C, Munoz-Montero S, Kelly-Garcia J, Vazquez-Manriquez ME, Santillan P, Ramirez MM, Ramirez-Martinez G, Ramirez-Venegas A, Ortiz-Quintero B. Deregulated MicroRNAs in Cancer-Associated Fibroblasts from Front Tumor Tissues of Lung Adenocarcinoma as Potential Predictors of Tumor Promotion. Tohoku J Exp Med. 2018 Oct; 246(2):107-120.
-
Barrera-Reyes PK, Hernandez-Ramirez N, Cortes J, Poquet L, Redeuil K, Rangel-Escareno C, Kussmann M, Silva-Zolezzi I, Tejero ME. Gene expression changes by high-polyphenols cocoa powder intake: a randomized crossover clinical study. Eur J Nutr. 2018 Jun 8; 1:.
-
Ortega-Bernal D, La Rosa CHG, Arechaga-Ocampo E, Alvarez-Avitia MA, Moreno NS, Rangel-Escareno C. A meta-analysis of transcriptome datasets characterizes malignant transformation from melanocytes and nevi to melanoma. Oncol Lett. 2018 Aug; 16(2):1899-1911.
-
Lira-Albarran S, Durand M, Barrera D, Vega C, Becerra RG, Diaz L, Garcia-Quiroz J, Rangel C, Larrea F. A single preovulatory administration of ulipristal acetate affects the decidualization process of the human endometrium during the receptive period of the menstrual cycle. Mol Cell Endocrinol. 2018 Apr 27; :.
-
Barajas-Olmos F, Centeno-Cruz F, Zerrweck C, Imaz-Rosshandler I, Martinez-Hernandez A, Cordova EJ, Rangel-Escareno C, Galvez F, Castillo A, Maydon H, Campos F, Maldonado-Pintado DG, Orozco L. Altered DNA methylation in liver and adipose tissues derived from individuals with obesity and type 2 diabetes. BMC Med Genet. 2018 Feb 21; 19(1):28.
-
Arenas-Hernandez M, Gomez-Lopez N, Garcia-Flores V, Rangel-Escareno C, Alvarez-Salas LM, Martinez-Acuna N, Vazquez-Perez JA, Vega-Sanchez R. Choriodecidual leukocytes display a unique gene expression signature in spontaneous labor at term. Genes Immun. 2019 Jan; 20(1):56-68.
-
Jimenez-Ortega RF, Ramirez-Salazar EG, Parra-Torres AY, Munoz-Montero SA, Rangel-Escareno C, Salido-Guadarrama I, Rodriguez-Dorantes M, Quiterio M, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Identification of microRNAs in human circulating monocytes of postmenopausal osteoporotic Mexican-Mestizo women: A pilot study. Exp Ther Med. 2017 Dec; 14(6):5464-5472.
-
Molina-Romero C, Rangel-Escareno C, Ortega-Gomez A, Alanis-Funes GJ, Aviles-Salas A, Avila-Moreno F, Mercado GE, Cardona AF, Hidalgo-Miranda A, Arrieta O. Differential Gene Expression Profiles According to the IASLC/ATS/ERS Histopathological Classification in Lung Adenocarcinoma Subtypes. Human Pathology. 2017 Jun 08; :.
-
Rueda-Zarate HA, Imaz-Rosshandler I, Cardenas-Ovando RA, Castillo-Fernandez JE, Noguez-Monroy J, Rangel-Escareno C. A computational toxicogenomics approach identifies a list of highly hepatotoxic compounds from a large microarray database. PLoS One. 2017; 12(4):e0176284.
-
Lira-Albarran S, Durand M, Larrea-Schiavon MF, Gonzalez L, Barrera D, Vega C, Gamboa-Dominguez A, Rangel C, Larrea F. Ulipristal acetate administration at mid-cycle changes gene expression profiling of endometrial biopsies taken during the receptive period of the human menstrual cycle. Mol Cell Endocrinol. 2017 Feb 20; :.
-
Rodríguez-Peredo SM., Castellanos-Jankiewicz AK., . Imaz-Rosshandler I., Espinoza-Camacho MA., Rangel-Escareño C., Muñoz-Sánchez JL., Melendez-Zajgla J., Tejero ME., Carbó R., Maldonado V., del Bosque-Plata L.. Modulation of the lung RNAome in a metabolic syndrome rat model. Am J Med Genet. 2017 FEB; 10(5):None.
-
Tejero ME., López-Martínez ME., Cardenas-Ovando RA., Rangel Escareño C., Binia A., Vargas-Martinez C., Ancira M., Gámez-Valdez E., Martinez-Soria D., Sebastian Medina L., Angeles-Quezada A., Gonzalez-Alberto R., Fernández S., Martínez-Conde D., Hernández-Morán B., Ramirez-Solano M., Rubio-Aliaga I., Vadillo-Ortega F., Kussmann M., Silva Zolezzi I.. Differences in the transcriptome of responders and non-responders on glucose metabolism markers after fish oil supplementation. Am J Med Genet. 2017 FEB; 31(11):None.
-
Olvera-Garcia G, Aguilar-Garcia T, Gutierrez-Jasso F, Imaz-Rosshandler I, Rangel-Escareno C, Orozco L, Aguilar-Delfin I, Vazquez-Perez JA, Zuniga J, Perez-Patrigeon S, Espinosa E. A transcriptome-based model of central memory CD4 T cell death in HIV infection. BMC Genomics. 2016 Nov 22; 17(1):956.
-
Lira-Albarran S, Larrea-Schiavon MF, Gonzalez L, Durand M, Rangel C, Larrea F. The effects of levonorgestrel on FSH-stimulated primary rat granulosa cell cultures through gene expression profiling are associated to hormone and folliculogenesis processes. Mol Cell Endocrinol. 2016 Sep 20; 439:337-345.
-
Srivastava AK, Wang Y, Huang R, Skinner C, Thompson T, Pollard L, Wood T, Luo F, Stevenson R, Polimanti R, Gelernter J, Lin X, Lim IY, Wu Y, Teh AL, Chen L, Aris IM, Soh SE, Tint MT, MacIsaac JL, Yap F, Kwek K, Saw SM, Kobor MS, Meaney MJ, Godfrey KM, Chong YS, Holbrook JD, Lee YS, Gluckman PD, Karnani N; GUSTO study group, Kapoor A, Lee D, Chakravarti A, Maercker C, Graf F, Boutros M, Stamoulis G, Santoni F, Makrythanasis P, Letourneau A, Guipponi M, Panousis N, Garieri M, Ribaux P, Falconnet E, Borel C, Antonarakis SE, Kumar S, Curran J, Blangero J, Chatterjee S, Akiyama J, Auer D, Berrios C, Pennacchio L, Donti TR, Cappuccio G, Miller M, Atwal P, Kennedy A, Cardon A, Bacino C, Emrick L, Hertecant J, Baumer F, Porter B, Bainbridge M, Bonnen P, Graham B, Sutton R, Sun Q, Elsea S, Hu Z, Wang P, Zhu Y, Zhao J, Xiong M, Bennett DA, Hidalgo-Miranda A, Romero-Cordoba S, Rodriguez-Cuevas S, Rebollar- Vega R, Tagliabue E, Iorio M, D’Ippolito E, Baroni S, Kaczkowski B, Tanaka Y, Kawaji H, Sandelin A, Andersson R, Itoh M, Lassmann T; The FANTOM5 Consortium, Hayashizaki Y, Carninci P, Forrest ARR, Semple CA, Rosenthal EA, Shirts B, Amendola L, Gallego C, Horike-Pyne M, Burt A, Robertson P, Beyers P, Nefcy C, Veenstra D, Hisama F, Bennett R, Dorschner M, Nickerson D, Smith J, Patterson K, Crosslin D, Nassir R, Zubair N, Harrison T, Peters U, Jarvik G; NHLBI GO Exome Sequencing Project, Menghi F, Inaki K, Woo X, Kumar P, Grzeda K, Malhotra A, Kim H, Ucar D, Shreckengast P, Karuturi K, Keck J, Chuang J, Liu ET, Ji B, Tyler A, Ananda G, Carter G, Nikbakht H, Montagne M, Zeinieh M, Harutyunyan A, Mcconechy M, Jabado N, Lavigne P, Majewski J, Goldstein JB, Overman M, Varadhachary G, Shroff R, Wolff R, Javle M, Futreal A, Fogelman D, Bravo L, Fajardo W, Gomez H, Castaneda C, Rolfo C, Pinto JA, Akdemir KC, Chin L, Futreal A; ICGC PCAWG Structural Alterations Group, Patterson S, Statz C, Mockus S, Nikolaev SN, Bonilla XI, Parmentier L, King B, Bezrukov F, Kaya G, Zoete V, Seplyarskiy V, Sharpe H, McKee T, Popadin K, Basset-Seguin N, Chaabene RB, Andrianova M, Verdan C, Grosdemange K, Sumara O, Eilers M, Aifantis I, Michielin O, de Sauvage F, Antonarakis S, Likhitrattanapisal S, Lincoln S, Kurian A, Desmond A, Yang S, Kobayashi Y, Ford J, Ellisen L, Peters TL, Alvarez KR, Hollingsworth EF, Lopez-Terrada DH, Hastie A, Dzakula Z, Pang AW, Lam ET, Anantharaman T, Saghbini M, Cao H; BioNano Genomics, Gonzaga-Jauregui C, Ma L, King A, Rosenzweig EB, Krishnan U, Reid JG, Overton JD, Dewey F, Chung WK, Small K, DeLuca A, Cremers F, Lewis RA, Puech V, Bakall B, Silva-Garcia R, Rohrschneider K, Leys M, Shaya FS, Stone E, Sobreira NL, Schiettecatte F, Ling H, Pugh E, Witmer D, Hetrick K, Zhang P, Doheny K, Valle D, Hamosh A, Jhangiani SN, Akdemir ZC, Bainbridge MN, Charng W, Wiszniewski W, Gambin T, Karaca E, Bayram Y, Eldomery MK, Posey J, Doddapaneni H, Hu J, Sutton VR, Muzny DM, Boerwinkle EA, Lupski JR, Gibbs RA, Shekar S, Salerno W, English A, Mangubat A, Bruestle J, Thorogood A, Knoppers BM; Global Alliance for Genomics and Health - Regulatory and Ethics Working Group, Takahashi H, Nitta KR, Kozhuharova A, Suzuki AM, Sharma H, Cotella D, Santoro C, Zucchelli S, Gustincich S, Mulvihill JJ, Baynam G, Gahl W, Groft SC, Kosaki K, Lasko P, Melegh B, Taruscio D, Ghosh R, Plon S, Scherer S, Qin X, Sanghvi R, Walker K, Chiang T, Muzny D, Wang L, Black J, Boerwinkle E, Weinshilboum R, Gibbs R, Karpinets T, Calderone T, Wani K, Yu X, Creasy C, Haymaker C, Forget M, Nanda V, Roszik J, Wargo J, Haydu L, Song X, Lazar A, Gershenwald J, Davies M, Bernatchez C, Zhang J, Woodman S, Chesler EJ, Reynolds T, Bubier JA, Phillips C, Langston MA, Baker EJ, Lin N, Amos C, Calhoun V, Dobretsberger O, Egger M, Leimgruber F, Sadedin S, Oshlack A; Melbourne Genomics Health Alliance, Antonio VAA, Ono N; Clark Kendrick C. Go, Ahmed Z, Bolisetty M, Zeeshan S, Anguiano E, Sarkar A, Nandineni MR, Zeng C, Shao J, Cao H, Liang T, Pham K, Chee-Wei Y, Dongsheng L, Lai-Ping W, Lian D, Hee ROT, Yunus Y, Aghakhanian F, Mokhtar SS, Lok-Yung CV, Bhak J, Phipps M, Shuhua X, Yik-Ying T, Kumar V, Boon-Peng H, Campbell I, Young MA, James P; Lifepool, Rain M, Mohammad G, Kukreti R, Pasha Q, Akilzhanova AR, Guelly C, Abilova Z, Rakhimova S, Akhmetova A, Kairov U, Trajanoski S, Zhumadilov Z, Bekbossynova M, Schumacher C, Sandhu S, Harkins T, Makarov V, Glenn R, Momin Z, Dilrukshi B, Chao H, Meng Q, Gudenkauf B, Kshitij R, Jayaseelan J, Nessner C, Lee S, Blankenberg K, Lewis L, Han Y, Dinh H, Jireh S, Buhay C, Liu X, Wang Q, Ding Y, Veeraraghavan N, Yang Y, Beaudet AL, Eng CM, Worley KCC, Liu Y, Hughes DST, Murali SC, Harris RA, English AC, Hampton OA, Larsen P, Beck C, Wang M, Kovar CL, Salerno WJ, Yoder A, Richards S, Rogers J, Raveenedran M, Xue C, Dahdouli M, Cox L, Fan G, Ferguson B, Hovarth J, Johnson Z, Kanthaswamy S, Kubisch M, Platt M, Smith D, Vallender E, Wiseman R, Below J, Yu F, Lin J, Zhang Y, Ouyang Z, Moore A, Wang Z, Hofmann J, Purdue M, Stolzenberg-Solomon R, Weinstein S, Albanes D, Liu CS, Cheng WL, Lin TT, Lan Q, Rothman N, Berndt S, Chen ES, Bahrami H, Khoshzaban A, Keshal SH, Alharbi KKR, Zhalbinova M, Akilzhanova A, Bekbosynova M, Myrzakhmetova S, Matar M, Mili N, Molinari R, Ma Y, Guerrier S, Elhawary N, Tayeb M, Bogari N, Qotb N, McClymont SA, Hook PW, Goff LA, McCallion A, Kong Y, Charette JR, Hicks WL, Naggert JK, Zhao L, Nishina PM, Edrees BM, Athar M, Al- Allaf FA, Taher MM, Khan W, Bouazzaoui A, Harbi NA, Safar R, Al-Edressi H, Anazi A, Altayeb N, Ahmed MA, Alansary K, Abduljaleel Z, Kratz A, Beguin P, Poulain S, Kaneko M, Takahiko C, Matsunaga A, Kato S, Bertin N, Lassmann T, Vigot R, Plessy C, Launey T, Graur D, Friis-Nielsen J, Izarzugaza JM, Brunak S, Chakraborty A, Basak J, Mukhopadhyay A, Soibam BS, Das D, Biswas N, Das S, Sarkar S, Maitra A, Panda C, Majumder P, Morsy H, Gaballah A, Samir M, Shamseya M, Mahrous H, Ghazal A, Arafat W, Hashish M, Gruber JJ, Jaeger N, Snyder M, Patel K, Bowman S, Davis T, Kraushaar D, Emerman A, Russello S, Henig N, Hendrickson C, Zhang K, Rodriguez-Dorantes M, Cruz-Hernandez CD, Garcia-Tobilla CDP, Solorzano-Rosales S, Jäger N, Chen J, Haile R, Hitchins M, Brooks JD, Jiménez-Morales S, Ramírez M, Nuñez J, Bekker V, Leal Y, Jiménez E, Medina A, Hidalgo A, Mejía J, Halytskiy V, Naggert J, Collin GB, DeMauro K, Hanusek R, Belhassa K, Belhassan K, Bouguenouch L, Samri I, Sayel H, moufid FZ, El Bouchikhi I, Trhanint S, Hamdaoui H, Elotmani I, Khtiri I, Kettani O, Quibibo L, Ahagoud M, Abbassi M, Ouldim K, Marusin AV, Kornetov AN, Swarovskaya M, Vagaiceva K, Stepanov V, De La Paz EMC, Sy R, Nevado J, Reganit P, Santos L, Magno JD, Punzalan FE, Ona D, Llanes E, Santos-Cortes RL, Tiongco R, Aherrera J, Abrahan L, Pagauitan-Alan P; The Philippine Cardiogenomics Study Group, Morelli KH, Domire JS, Pyne N, Harper S, Burgess R, Gari MA, Dallol A, Alsehli H, Gari A, Gari M, Abuzenadah A, Thomas M, Sukhai M, Garg S, Misyura M, Zhang T, Schuh A, Stockley T, Kamel-Reid S, Sherry S, Xiao C, Slotta D, Rodarmer K, Feolo M, Kimelman M, Godynskiy G, O’Sullivan C, Yaschenko E, Rangel-Escareño C, Rueda-Zarate H, Tayubi IA, Mohammed R; on behalf of 1, Ahmed I, Ahmed T, Seth S, Amin S, Mao X, Sun H, Verhaak RG, Whiite SJ, Farek J, Kahn Z, Kasukawa T, Lizio M, Harshbarger J, Hisashi S, Severin J, Imad A, Sahin S, Freeman TC, Baillie K, Kawaji H; The FANTOM Consortium, Shekar SN, Salem AH, Ali M, Ibrahim A, Ibrahim M, Barrera HA, Garza L, Torres JA, Barajas V, Ulloa-Aguirre A, Kershenobich D, Mortaji S, Guizar P, Loera E, Moreno K, De León A, Monsiváis D, Gómez J, Cardiel R, Fernandez-Lopez JC, Bonifaz-Peña V, Contreras AV, Polfus L; CHARGE and NHLBI Exome Sequence Project Working Groups, Wang X, Philip V, Abuzenadah AA, Turki R, Uyar A, Kaygun A, Zaman S, Marquez E, George J, Hendrickson CL, Starr DB, Baird M, Kirkpatrick B, Sheets K, Nitsche R, Prieto-Lafuente L, Landrum M, Lee J, Rubinstein W, Maglott D, Thavanati PKR, de Dios AE, Hernandez REN, Aldrate MEA, Mejia MRR, Kanala KRR, Al-Allaf FA, Shahzad N, Huber E, Dan A, Herr W, Sprotte G, Köstler J, Hiergeist A, Gessner A, Andreesen R, Holler E, Al-Allaf F, Alashwal A, Taher M, Abalkhail H, Al-Allaf A, Bamardadh R, Filiptsova O, Kobets M, Kobets Y, Burlaka I, Timoshyna I, Kobets MN, Mohiuddin MT, Zainularifeen A, Mohammed A, Owaidah T. Human genome meeting 2016 : Houston, TX, USA. 28 February - 2 March 2016. Hum Genomics. 2016 May 26; 10 Suppl 1(Suppl 1):12.
-
Ortega-Gomez A, Rangel-Escareno C, Molina-Romero C, Macedo-Perez EO, Aviles-Salas A, Lara-Garcia A, Alanis-Funes G, Rodriguez-Bautista R, Hidalgo-Miranda A, Arrieta O. Gene-expression profiles in lung adenocarcinomas related to chronic wood smoke or tobacco exposure. Respir Res. 2016; 17(1):42.
-
Salido-Guadarrama AI, Morales-Montor JG, Rangel-Escareno C, Langley E, Peralta-Zaragoza O, Cruz Colin JL, Rodriguez-Dorantes M. Urinary microRNA-based signature improves accuracy of detection of clinically relevant prostate cancer within the prostate-specific antigen grey zone. Mol Med Rep. 2016 Apr 8; 13(6):4549-60.
-
Fernandez-Figueroa EA, Imaz-Rosshandler I, Castillo-Fernandez JE, Miranda-Ortiz H, Fernandez-Lopez JC, Becker I, Rangel-Escareno C. Down-Regulation of TLR and JAK/STAT Pathway Genes Is Associated with Diffuse Cutaneous Leishmaniasis: A Gene Expression Analysis in NK Cells from Patients Infected with Leishmania mexicana. PLoS Neglected Tropical Diseases. 2016 Mar; 10(3):e0004570.
-
Pineda AL, Ogoe HA, Balasubramanian JB, Rangel Escareno C, Visweswaran S, Herman JG, Gopalakrishnan V. On Predicting lung cancer subtypes using 'omic' data from tumor and tumor-adjacent histologically-normal tissue. BMC Cancer. 2016; 16(1):184.
-
Checa M, Hagood JS, Velazquez-Cruz R, Ruiz V, Garcia-De-Alba C, Rangel-Escareno C, Urrea F, Becerril C, Montano M, Garcia-Trejo S, Cisneros Lira J, Aquino-Galvez A, Pardo A, Selman M. Cigarette Smoke Enhances the Expression of Profibrotic Molecules in Alveolar Epithelial Cells. PLoS One. 2016; 11(3):e0150383.
-
Bermudez M, Imaz-Rosshandler I, Rangel-Escareno C, Zeichner-David M, Arzate H, Mercado-Celis GE. CEMP1 Induces Transformation in Human Gingival Fibroblasts. PLoS One. 2015; 10(5):e0127286.
-
Contreras AV, Rangel-Escareno C, Torres N, Aleman-Escondrillas G, Ortiz V, Noriega LG, Torre-Villalvazo I, Granados O, Velazquez-Villegas LA, Tobon-Cornejo S, Gonzalez-Hirschfeld D, Recillas-Targa F, Tejero-Barrera E, Gonzalez FJ, Tovar AR. PPARalpha via HNF4alpha regulates the expression of genes encoding hepatic amino acid catabolizing enzymes to maintain metabolic homeostasis.. Genes Nutr. 2015 Mar; 10(2):452.
-
Bonifaz-Pena V, Contreras AV, Struchiner CJ, Roela RA, Furuya-Mazzotti TK, Chammas R, Rangel-Escareno C, Uribe-Figueroa L, Gomez-Vazquez MJ, McLeod HL, Hidalgo-Miranda A, Parra EJ, Fernandez-Lopez JC, Suarez-Kurtz G. Exploring the distribution of genetic markers of pharmacogenomics relevance in brazilian and mexican populations. PLoS One. 2014; 9(11):e112640.
-
Cardenas G, Fragoso G, Rosetti M, Uribe-Figueroa L, Rangel-Escareno C, Saenz B, Hernandez M, Sciutto E, Fleury A. Neurocysticercosis: the effectiveness of the cysticidal treatment could be influenced by the host immunity. Med Microbiol Immunol. 2014 Jun 24; 203(6):373-81.
-
Ojesina AI, Lichtenstein L, Freeman SS, Pedamallu CS, Imaz-Rosshandler I, Pugh TJ, Cherniack AD, Ambrogio L, Cibulskis K, Bertelsen B, Romero-Cordoba S, Trevino V, Vazquez-Santillan K, Guadarrama AS, Wright AA, Rosenberg MW, Duke F, Kaplan B, Wang R, Nickerson E, Walline HM, Lawrence MS, Stewart C, Carter SL, McKenna A, Rodriguez-Sanchez IP, Espinosa-Castilla M, Woie K, Bjorge L, Wik E, Halle MK, Hoivik EA, Krakstad C, Gabino NB, Gomez-Macias GS, Valdez-Chapa LD, Garza-Rodriguez ML, Maytorena G, Vazquez J, Rodea C, Cravioto A, Cortes ML, Greulich H, Crum CP, Neuberg DS, Hidalgo-Miranda A, Escareno CR, Akslen LA, Carey TE, Vintermyr OK, Gabriel SB, Barrera-Saldana HA, Melendez-Zajgla J, Getz G, Salvesen HB, Meyerson M. Landscape of genomic alterations in cervical carcinomas. Nature. 2014-02-20; 506(7488):371-375.
-
Adalid-Peralta L, Arce-Sillas A, Fragoso G, Cardenas G, Rosetti M, Casanova-Hernandez D, Rangel-Escareno C, Uribe-Figueroa L, Fleury A, Sciutto E. Cysticerci drive dendritic cells to promote in vitro and in vivo tregs differentiation. Clin Dev Immunol. 2013; 2013:981468.
-
Penuelas-Urquides K, Gonzalez-Escalante L, Villarreal-Trevino L, Silva-Ramirez B, Gutierrez-Fuentes DJ, Mojica-Espinosa R, Rangel-Escareno C, Uribe-Figueroa L, Molina-Salinas GM, Davila-Velderrain J, Castorena-Torres F, Bermudez de Leon M, Said-Fernandez S. Comparison of Gene Expression Profiles Between Pansensitive and Multidrug-Resistant Strains of Mycobacterium tuberculosis. Curr Microbiol. 2013 May 7; 67(3):362-71.
-
Mendoza-Milla C, Valero Jimenez A, Rangel C, Lozano A, Morales V, Becerril C, Chavira R, Ruiz V, Barrera L, Montano M, Pardo A, Selman M. Dehydroepiandrosterone has strong antifibrotic effects and is decreased in idiopathic pulmonary fibrosis.. Eur Respir J. 2013 Nov; 42(5):1309-21.
-
Edith A Fernández-Figueroa, Claudia Rangel-Escareño, Valeria Espinosa-Mateos, Karol Carrillo-Sánchez, Norma Salaiza-Suazo, Georgina Carrada-Figueroa, Santiago March-Mifsut, Ingeborg Becker. Disease Severity In Patients Infected With Leishmania Mexicana Relates To Il-1B. PLoS Neglected Tropical Diseases. 2012; :0-0.
-
Banerji S, Cibulskis K, Rangel-Escareno C, Brown KK, Carter SL, Frederick AM, Lawrence MS, Sivachenko AY, Sougnez C, Zou L, Cortes ML, Fernandez-Lopez JC, Peng S, Ardlie KG, Auclair D, Bautista-Pina V, Duke F, Francis J, Jung J, Maffuz-Aziz A, Onofrio RC, Parkin M, Pho NH, Quintanar-Jurado V, Ramos AH, Rebollar-Vega R, Rodriguez-Cuevas S, Romero-Cordoba SL, Schumacher SE, Stransky N, Thompson KM, Uribe-Figueroa L, Baselga J, Beroukhim R, Polyak K, Sgroi DC, Richardson AL, Jimenez-Sanchez G, Lander ES, Gabriel SB, Garraway LA, Golub TR, Melendez-Zajgla J, Toker A, Getz G, Hidalgo-Miranda A, Meyerson M. Sequence analysis of mutations and translocations across breast cancer subtypes. Nature. 2012 Jun 21; 486(7403):405-9.
-
Lohr JG, Stojanov P, Lawrence MS, Auclair D, Chapuy B, Sougnez C, Cruz-Gordillo P, Knoechel B, Asmann YW, Slager SL, Novak AJ, Dogan A, Ansell SM, Link BK, Zou L, Gould J, Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareno C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Hernandez-Lemus E, Schwarz-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR. Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by whole-exome sequencing. Proc Natl Acad Sci USA. 2012 Mar 6; 109(10):3879-84.
-
Jimenez-Lopez S, Mancera-Martinez E, Donayre-Torres A, Rangel C, Uribe L, March S, Jimenez-Sanchez G, Sanchez de Jimenez E. Expression profile of maize (Zea mays L.) embryonic axes during germination: translational regulation of ribosomal protein mRNAs. Plant Cell Physiol. 2011 Oct; 52(10):1719-33.
-
Stransky N, Egloff AM, Tward AD, Kostic AD, Cibulskis K, Sivachenko A, Kryukov GV, Lawrence MS, Sougnez C, McKenna A, Shefler E, Ramos AH, Stojanov P, Carter SL, Voet D, Cortes ML, Auclair D, Berger MF, Saksena G, Guiducci C, Onofrio RC, Parkin M, Romkes M, Weissfeld JL, Seethala RR, Wang L, Rangel-Escareno C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Winckler W, Ardlie K, Gabriel SB, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Golub TR, Garraway LA, Grandis JR. The mutational landscape of head and neck squamous cell carcinoma. Science. 2011 Aug 26; 333(6046):1157-60.
-
Baca-Lopez K, Correa-Rodriguez Md, Flores-Espinosa R, Garcia-Herrera R, Hernandez-Armenta Ci, Hidalgo-Miranda A, Huerta-Verde Aj, Imaz-Rosshandler I, Martinez-Rubio Av, Medina-Escareno A, Mendoza-Smith R, Rodriguez-Dorantes M, Salido-Guadarrama I, Hernandez-Lemus E, Rangel-Escareno C. A Three-State Model For Multidimensional Genomic Data Integration. CAMDA. 2011; :0-0.
-
Frigolet ME, Torres N, Uribe-Figueroa L, Rangel C, Jimenez-Sanchez G, Tovar AR. White adipose tissue genome wide-expression profiling and adipocyte metabolic functions after soy protein consumption in rats. J Nutr Biochem. 2010 May; 22(2):118-29.
-
Mendoza-Villanueva D, Diaz-Chavez J, Uribe-Figueroa L, Rangel-Escareao C, Hidalgo-Miranda A, March-Mifsut S, Jimenez-Sanchez G, Lambert P, Gariglio P. Gene expression profile of cervical and skin tissues from human papillomavirus type 16 E6 transgenic mice. BMC Cancer. 2008; 8:347.
-
Hull ML, Escareno CR, Godsland JM, Doig JR, Johnson CM, Phillips SC, Smith SK, Tavare S, Print CG, Charnock-Jones DS. Endometrial-peritoneal interactions during endometriotic lesion establishment. Am J Pathol. 2008 Sep; 173(3):700-15.
-
Claudia Rangel-Escareno, Irma Aguilar-Delfin, David Wild. Inference Of Key Transcriptional Regulators In Endothelial Cell Apoptosis Using Bayesian State Space Models. Proceedings of the 8th international conference for the Critical Assessment of Microarray Data Analysis (CAMDA 2008). 2008; :58-62.
-
Beal MJ, Falciani F, Ghahramani Z, Rangel C, Wild DL. A Bayesian approach to reconstructing genetic regulatory networks with hidden factors. Bioinformatics. 2005 Feb 1; 21(3):349-56.
-
Rangel C, Angus J, Ghahramani Z, Lioumi M, Sotheran E, Gaiba A, Wild DL, Falciani F. Modeling T-cell activation using gene expression profiling and state-space models. Bioinformatics. 2004 Jun 12; 20(9):1361-72.
-
Dubey A, Hwang S, Rangel C, Rasmussen CE, Ghahramani Z, Wild DL. Clustering protein sequence and structure space with infinite Gaussian mixture models. Pacific Symposium on Biocomputing. 2004; :399-410.
-
Rangel C, Wild DL, Falciani F. Modeling T-Cell Activation Using Gene Expression Profiling And Linear Dynamical Systems. Proc. 2nd International Conference on Systems Biology. 2001; :248-256.
- Hernandez-Lemus E., Rangel-Escareño C.. THE ROLE OF INFORMATION THEORY IN GENE REGULATORY NETWORK INFERENCE. P. DELOUMEAUX ET AL. Information Theory: New Research. NOVA SCIENCE; 2011.
- John Angus, Matthew J. Beal, Juan Li, Claudia Rangel and David L. Wild (NOTA: Autores en orden alfabético) ISBN 978-0-262-01386-4. INFERRING TRANSCRIPTIONAL NETWORKS USING PRIOR BIOLOGICAL KNOWLEDGE AND CONSTRAINED STATE SPACE MODELS. NEIL D. LAWRENCE, MARK GIROLAMI, MAGNUS RATTRAY, GUIDO SANG. Learning and Inference in Computational Systems Biology. THE MIT PRESS (IN PRESS); 2010. 366
- Claudia Rangel, John Angus, Zoubin Ghahramani, and David Wild. MODELING BIOLOGICAL RESPONSES USING GENE EXPRESSION PROFILING AND STATE SPACE MODELS. SPRINGER VERLAG. Applications of Probabilistic Modelling in Medical Informatics and Bioinformatics. SPRINGER VERLAG; 2003.
- 2011 - Instituto Carlos Slim de la Salud, Beca carlos slim para estancias de capacitación en genómica en el extranjero
- 2010 - Instituto Carlos Slim de la Salud, Beca carlos slim para estancias de capacitación en genómica en el extranjero
- 2006 - INMEGEN, Beca para ii congreso de medicina genómica
- 2002 - PHI BETA KAPPA ALUMNI IN SOUTHERN CALIFORNIA, Scholarship
- 2002 - SAN DIEGO STATE UNIVERSITY, First pan-american advanced studies institute felllowship
- 2001 - INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, Recomb travel fellowship
Diplomado
- Introducción al análisis de datos genómicos, FUNDACION ARTURO ROSENBLUETH, A.C.
Doctorado
- MATh365 Computational Methods for Molecular Biology, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
- Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
- Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
- Math364 Introduction to Scientific Computing, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
- MATH 364: Introduction to Scientific Computing, CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
Especialidad
- Bases de la Genómica Computacional, INSTITUTO NACIONAL DE MEDICINA GENÓMICA
- Genómica Computacional, INSTITUTO NACIONAL DE MEDICINA GENÓMICA
Maestria
- Introducción a la Medicina Genómica/ Cátedra: Herramientas computacionales en expresión genómica, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
- Aplicaciones Genómicas en Medicina Interna/Cátedra:Herramientas Computacionales en Expresión Genómic, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO / COORDINACION DE INVESTIGACION CIENTIFICA / FACULTAD DE MEDICINA / DIVISION DE ESTUDIOS DE POSTGRADO
- Math 364: Introduction to Scientific Computing (Impartido en línea), CLAREMONT GRADUATE UNIVERSITY
Estudiantes
- MULTIDIMENSIONAL DATA AND INTEGRATIVE GENOMICS, Conferencias, PASI: Panamerican Advanced Studies Institute, Facultad de Estadística e Informática, Universidad Veracruzana, Xalapa, Veracruz. 2011-08-11
- IMPORTANT ASPECTS IN DESIGN AND STATISTICAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION DATA, Conferencias, PASI: Panamerican Advanced Studies Institute, Facultad de Estadística e Informática, Universidad Veracruzana, Xalapa, Veracruz. 2011-08-11
- IMPLEMENTACIÓN DE UN MODELO DE ESPACIO-ESTADO PARA INFERIR LA DINÁMICA DE REGULACIÓN DE GENES, Conferencias, FES ACATLÁN. 2009-03-25
- Aplicaciones Matemáticas en el Estudio del Genoma Humano, Conferencias, Instituto Tecnológico Autónomo de México ITAM. 2006-09-08
Público en General
- CLASSICAL AND BAYESIAN APPROACHES TO RECONSTRUCTING GENETIC REGULATORY NETWORKS, Conferencias, 12th International Conference on Intelligent Systems and Molecular Biology ISMB 2004. 2004-07-28
Sector Académico
- COMPREHENSIVE OVERVIEW OF INTRINSIC BREAST CANCER SUBTYPES IN MEXICAN AND VIETNAMESE POPULATIONS, Seminarios, Warwick Sistems Biology Centre Seminar, University of Warwick. 2011-07-11
- ALGORITMOS DE ALINEAMIENTO GLOBAL Y LOCAL EN SECUENCIACIÓN MASIVA (PONENTE INVITADO), Conferencias, Centro de Ciencias Genomicas. 2010-08-02
- NUEVAS APLICACIONES MATEMÁTICAS Y FÍSICAS: GENÓMICA, BIOLOGÍA MOLECULAR, BIOINFORMÁTICA Y MEDICINA, Talleres, Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Campus Cd. de México. 2010-07-26
- LEARNING AND INFERENCE IN COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOLOGY (PONENTE INVITADO), Conferencias, CIMAT & RICE UNIVERSITY. 2010-05-05
- APPLICATION OF DI-BASE SEQUENCING TO SNPS DETECTION IN THE AB SOLIDTM SYSTEM, Conferencias, CIMAT and RICE UNIVERSITY. 2010-05-04
- LA ESTADÍSTICA EN EL ESTUDIO DEL GENOMA HUMANO, Conferencias, Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey. 2010-03-25
- MÉTODOS ESTADÍSTICOS Y ANALÍTICOS DE DATOS GENÓMICOS, Talleres, IBT - UNAM. 2010-01-18
- DYNAMIC MODELING OF GENE EXPRESSION DATA, Conferencias, Centro de Investigación en Matemáticas CIMAT. 2008-02-23
- Second Annual Center for Excellence in Genomic Science Research Symposium, Simposium, University of Southern California - Computational and Molecular Biology Department. 2006-04-08
- POSTER PRESENTATION, Simposium, 1st Southern California Applied Mathematics Symposium SoCAMS. 2001-05-12
Tesista de Doctorado
Tesista de Maestría
Estancia Voluntaria
- Postdoctoral research associate, Universidad Del Sur De California (2006-05-31)
- Matematico, Universidad Autonoma Metropolitana / Unidad Iztapalapa / Division De Ciencias Basicas E Ingenieria (Cbi) / Departamento De Matematicas (1991-04-19)
En curso
- Análisis de la prevalencia de mutaciones asociadas a la selección y respuesta al tratamiento en tumores de mama, colorrectales y de pulmón mediante secuenciación masiva en paralelo de un panel de 137 genes.
- Asociación Estructural Huesped-Parásito en Leishmania Mexicana
- Genómica y Adicciones. Subproyecto de la Encuesta Nacional de Consumo de Drogas, Alcohol y Tabaco, 2016
Terminados
- Análisis de cambios en la expresión génica inducidos por LPG de Leishamaniasis en células NK de pacientes con Leishmaniasis cutánea localizada y difusa
- Análisis de expresión de microRNAs en suero de mujeres postmenopáusicas: búsqueda de biomarcadores no invasivos del metabolismo óseo para el diagnóstico de la osteoporosis
- Análisis e implementación de algoritmos como herramientas computacionales para el mapeo de datos de secuenciación masiva de applied biosystems solid a un genoma de referencia para aplicaciones a genómica funcional
- Efecto de la proteína dieteria sobre la expresión de enzimas degradadoras de aminoácidos mediada por PPAR?
- Estudio del epigenoma en pacientes adolescentes y adultos con intento de suicidio y suicidio consumado
- Evaluación y validación precomercial de una plataforma bioinformática para el análisis de datos genómicos
- Genómica funcional en la germinación del Maíz mecanismos de control traduccional
- Identificación de biomarcadores asociados a la variación de la Densidad Mineral Ósea mediante análisis de miRNAs en monocitos circulantes de sangre periférica en mujeres postmenopáusicas mexicanas.
- Identificación de las variables genéticas comunes asociadas a enfermedades psiquiátricas en población mexicana mediante un microarreglo consensado para el diseño de un perfil de diagnóstico molecular
- Identificación de microRNAs involucrados en la diferenciación de monocitos a osteoclastos y su papel en la variación de la densidad mineral Ósea.
- Identificación de variantes funcionales en genes candidato asociados con el riesgo al desarrollo de síndrome metabólico en grupos indígenas y población mestiza mexicana
- Metagenómica de enfermedades infecciosas emergentes y reemergentes transmitidas por artrópodos de la zona del Golfo de México
- Modelo basado en redes Bayesianas dinámicas para inferir la regulación de microRNAs y mensajero en respuesta a andrógenos en cáncer
Licenciatura
- Ivan Imaz Rosshandler. Análisis comparativo de algoritmos de normalización en datos de microarreglos de alta densidad. UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO.
- Erika Lagos Suarez. Selección de características principales en datos de expresión de microarreglos mediante método de Monte Carlo. INSTITUTO TECNOLOGICO AUTONOMO DE MEXICO / DIVISION ACADEMICA DE ACTUARIA ESTADISTICA Y MATEMATICAS / DEPARTAMENTO DE MATEMATICAS.
Maestria
- Daniel Ortega Bernal. Desarrollo de un meta-análisis de datos complejos en Biología computacional. UNIVERSIDAD AUTONOMA DE LA CIUDAD DE MEXICO / DEL VALLE UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE LA CIUDAD DE MÉXICO.
Ha colaborado en proyectos y/o publicaciones con:
|
|
|
||
La legalidad, veracidad y la calidad de la información es estricta responsabilidad de la dependencia, entidad o empresa productiva del Estado que la proporcionó en virtud de sus atribuciones y/o facultades normativas.