Sitio del Instituto Nacional de Medicina Genómica

Cursó la licenciatura en Química Farmacéutica Biológica en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco; obtuvo el grado de Maestría en Biomedicina Molecular en el Instituto Politécnico Nacional y el Doctorado en Ciencias Biomédicas de la Facultad de Medicina en la Universidad Nacional Autónoma de México, así como el posdoctorado en el Departamento de Genética, Microbiología y Estadística de la Facultad de Biología en la Universidad de Barcelona. Actualmente es Investigador en Ciencias Médicas “D”, adscrito al laboratorio de Genómica del Metabolismo Óseo del INMEGEN y miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) Nivel II.
En 2005 inició o colabora en las líneas de investigación: Genómica de las enfermedades autoinmunes, Genómica de Enfermedades Hepáticas, Genómica de enfermedades metabólicas, Genómica del metabolismo Óseo, Genómica del Microbioma y Proteómica, englobando proyectos dirigidos a la búsqueda de biomarcadores y marcadores de riesgo genético, entre otros temas. Estas líneas han tenido contribuciones importantes, tales como la identificación de microRNAs como potenciales biomarcadores y como herramienta de apoyo en el diagnóstico del Osteosarcoma y de la Osteoporosis; aunado a que su grupo de investigación es pionero en la identificación de los factores genéticos de la osteoporosis en la población mexicana.
Ha publicado 37 artículos de investigación en revistas internacionales y nacionales y 1 capítulo de libro. Muchos de los resultados de las líneas mencionados se han publicado en revistas del más alto impacto, tales como Journal Bone Mineral Research, Annals of Rheumatic Diseases y PLoS One, y cuenta con cerca de 750 citas. Ha dirigido 12 de tesis, que incluyen 1 de doctorado, 8 de maestría y 3 de licenciatura. Desde 2005 es profesor del Posgrado de Ciencias Biomédicas y del Posgrado en Ciencias Biológicas de la UNAM. Ha recibido 5 premios y distinciones. Destaca su participación como Miembro de la red temática de Envejecimiento, Salud y Desarrollo Social.

Artículos

• Contreras-Cubas C, Garcia-Ortiz H, Velazquez-Cruz R, Barajas-Olmos F, Baca P, Martinez-Hernandez A, Barbosa-Cobos RE, Ramirez-Bello J, Lopez-Hernandez MA, Svyryd Y, Mutchinick OM, Baca V, Orozco L. Catalytically Impaired TYK2 Variants are Protective Against Childhood- and Adult-Onset Systemic Lupus Erythematosus in Mexicans. Sci Rep. 2019 Aug 21; 9(1):12165.

• Hidalgo-Bravo A, Parra-Torres AY, Casas-Avila L, Jimenez-Ortega RF, Ramirez-Salazar EG, Patino N, Rivera-Paredez B, Salmeron J, Valdes-Flores M, Velazquez-Cruz R. Association of RMND1/CCDC170-ESR1 single nucleotide polymorphisms with hip fracture and osteoporosis in postmenopausal women. Climacteric. 2019 Jan 2; :1-8.

• Langley E, Velazquez-Cruz R, Parra-Torres A, Enriquez J. The Non-Aromatic Delta5-Androstenediol Derivative of Dehydroepiandrosterone Acts as an Estrogen Agonist in Neonatal Rat Osteoblasts through an Estrogen Receptor alpha-related Mechanism. Endocr Res. 2018 Dec 24; :1-16.

• Denova-Gutierrez E, Clark P, Capozza RF, Nocciolino LM, Ferretti JL, Velazquez-Cruz R, Rivera B, Cointry GR, Salmeron J. Differences in the relation between bone mineral content and lean body mass according to gender and reproductive status by age ranges. J Bone Miner Metab. 2018 Dec 4; :.

• Leon-Mimila P, Villamil-Ramirez H, Lopez-Contreras BE, Moran-Ramos S, Macias-Kauffer LR, Acuna-Alonzo V, Del Rio-Navarro BE, Salmeron J, Velazquez-Cruz R, Villarreal-Molina T, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S. Low Salivary Amylase Gene (AMY1) Copy Number Is Associated with Obesity and Gut Prevotella Abundance in Mexican Children and Adults. Nutrients. 2018 Nov 1; 10(11):.

• De-La-Cruz-Montoya AH, Ramirez-Salazar EG, Martinez-Aguilar MM, Gonzalez-de-la-Rosa PM, Quiterio M, Abreu-Goodger C, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Identification of miR-708-5p in peripheral blood monocytes: Potential marker for postmenopausal osteoporosis in Mexican-Mestizo population. Exp Biol Med (Maywood). 2018 Oct 15; :1535370218806828.

• Macias-Kauffer LR, Villamil-Ramirez H, Leon-Mimila P, Jacobo-Albavera L, Posadas-Romero C, Posadas-Sanchez R, Lopez-Contreras BE, Moran-Ramos S, Romero-Hidalgo S, Acuna-Alonzo V, Del-Rio-Navarro BE, Bortolini MC, Gallo C, Bedoya G, Rothhammer F, Gonzalez-Jose R, Ruiz-Linares A, Stephens CR, Velazquez-Cruz R, Fernandez Del Valle-Laisequilla C, Reyes-Garcia JG, Barranco Garduno LM, Carrasco-Portugal MDC, Flores-Murrieta FJ, Vargas-Alarcon G, Aguilar-Salinas CA, Villarreal-Molina T, Canizales-Quinteros S. Genetic contributors to serum uric acid levels in Mexicans and their effect on premature coronary artery disease. Int J Cardiol. 2018 Oct 1; :.

• Gonzalez-Pena SM, Campos-Gongora E, Avila-Rodriguez HG, Ramirez-Lopez E, Velazquez-Cruz R, Jimenez-Salas Z. JAG1, MEF2C and BDNF polymorphisms associated with bone mineral density in women from Northern Mexico. Biomedica. 2018 Sep 1; 38(3):320-328.

• Ramirez-Salazar EG, Carrillo-Patino S, Hidalgo-Bravo A, Rivera-Paredez B, Quiterio M, Ramirez-Palacios P, Patino N, Valdes-Flores M, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Serum miRNAs miR-140-3p and miR-23b-3p as potential biomarkers for osteoporosis and osteoporotic fracture in postmenopausal Mexican-Mestizo women. Gene. 2018 Dec 30; 679:19-27.

• Rivera-Paredez B, Macias N, Martinez-Aguilar MM, Hidalgo-Bravo A, Flores M, Quezada-Sanchez AD, Denova-Gutierrez E, Cid M, Martinez-Hernandez A, Orozco L, Quiterio M, Flores YN, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Association between Vitamin D Deficiency and Single Nucleotide Polymorphisms in the Vitamin D Receptor and GC Genes and Analysis of Their Distribution in Mexican Postmenopausal Women. Nutrients. 2018 Aug 27; 10(9):.

• Monterde-Cruz L, Ramirez-Salazar EG, Rico-Martinez G, Linares-Gonzalez LM, Guzman-Gonzalez R, Delgado-Cedillo E, Estrada-Villasenor E, Valdes-Flores M, Velazquez-Cruz R, Hidalgo-Bravo A. Circulating miR-215-5p and miR-642a-5p as potential biomarker for diagnosis of osteosarcoma in Mexican population. Hum Cell. 2018 Jun 15; :.

• Larrieta-Carrasco E, Flores YN, Macias-Kauffer LR, Ramirez-Palacios P, Quiterio M, Ramirez-Salazar EG, Leon-Mimila P, Rivera-Paredez B, Cabrera-Alvarez G, Canizales-Quinteros S, Zhang ZF, Lopez-Perez TV, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Genetic variants in COL13A1, ADIPOQ and SAMM50, in addition to the PNPLA3 gene, confer susceptibility to elevated transaminase levels in an admixed Mexican population. Exp Mol Pathol. 2018 Feb; 104(1):50-58.

• Jimenez-Ortega RF, Ramirez-Salazar EG, Parra-Torres AY, Munoz-Montero SA, Rangel-Escareno C, Salido-Guadarrama I, Rodriguez-Dorantes M, Quiterio M, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. Identification of microRNAs in human circulating monocytes of postmenopausal osteoporotic Mexican-Mestizo women: A pilot study. Exp Ther Med. 2017 Dec; 14(6):5464-5472.

• Villalobos-Comparan M, Jimenez-Ortega RF, Estrada K, Parra-Torres AY, Gonzalez-Mercado A, Patino N, Castillejos-Lopez M, Quiterio M, Fernandez-Lopez JC, Ibarra B, Romero-Hidalgo S, Salmeron J, Velazquez-Cruz R. A Pilot Genome-Wide Association Study in Postmenopausal Mexican-Mestizo Women Implicates the RMND1/CCDC170 Locus Is Associated with Bone Mineral Density. Int J Genomics. 2017; 2017:5831020.

• Villalobos-Comparan M, Antuna-Puente B, Villarreal-Molina MT, Canizales-Quinteros S, Velazquez-Cruz R, Leon-Mimila P, Villamil-Ramirez H, Gonzalez-Barrios JA, Merino-Garcia JL, Thompson-Bonilla MR, Jarquin D, Sanchez-Hernandez OE, Rodriguez-Arellano ME, Posadas-Romero C, Vargas-Alarcon G, Campos-Perez F, Quiterio M, Salmeron-Castro J, Carnevale A, Romero-Hidalgo S. Interaction between FTO rs9939609 and the Native American-origin ABCA1 rs9282541 affects BMI in the admixed Mexican population. BMC Med Genet. 2017 May 02; 18(1):46.

• Flores YN, Velazquez-Cruz R, Ramirez P, Banuelos M, Zhang ZF, Yee HF Jr, Chang SC, Canizales-Quinteros S, Quiterio M, Cabrera-Alvarez G, Patino N, Salmeron J. Association between PNPLA3 (rs738409), LYPLAL1 (rs12137855), PPP1R3B (rs4240624), GCKR (rs780094), and elevated transaminase levels in overweight/obese Mexican adults. Mol Biol Rep. 2016 Oct 17; :.

• Vargas-Alarcon G, Martinez-Rodriguez N, Velazquez-Cruz R, Perez-Mendez O, Posadas-Sanchez R, Posadas-Romero C, Pena-Duque MA, Martinez-Rios MA, Ramirez-Fuentes S, Fragoso JM. The T>A (rs11646213) gene polymorphism of cadherin-13 (CDH13) gene is associated with decreased risk of developing hypertension in Mexican population. Immunobiology. 2016 Sep 21; :.

• Enriquez J, Velazquez-Cruz R, Parra-Torres A, Gutierrez-Sagal R, Larrea F. The anti-estrogenic activity of indole-3-carbinol in neonatal rat osteoblasts is associated with the estrogen receptor antagonist 2-hydroxyestradiol. J Endocrinol Invest. 2016 Jun 16; :.

• Checa M, Hagood JS, Velazquez-Cruz R, Ruiz V, Garcia-De-Alba C, Rangel-Escareno C, Urrea F, Becerril C, Montano M, Garcia-Trejo S, Cisneros Lira J, Aquino-Galvez A, Pardo A, Selman M. Cigarette Smoke Enhances the Expression of Profibrotic Molecules in Alveolar Epithelial Cells. PLoS One. 2016; 11(3):e0150383.

• Torres LM, Rivera-Espinosa L, Chavez-Pacheco JL, Navas CF, Demetrio JA, Alemon-Medina R, Trujillo F, Perez M, Zapata MM, Cardenas R, Salinas C, Aquino A, Velazquez-Cruz R, Castillejos MD. A New Method to Quantify Ifosfamide Blood Levels Using Dried Blood Spots and UPLC-MS/MS in Paediatric Patients with Embryonic Solid Tumours. PLoS One. 2015; 10(11):e0143421.

• Leon-Mimila P, Vega-Badillo J, Gutierrez-Vidal R, Villamil-Ramirez H, Villareal-Molina T, Larrieta-Carrasco E, Lopez-Contreras BE, Kauffer LR, Maldonado-Pintado DG, Mendez-Sanchez N, Tovar AR, Hernandez-Pando R, Velazquez-Cruz R, Campos-Perez F, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S. A genetic risk score is associated with hepatic triglyceride content and non-alcoholic steatohepatitis in Mexicans with morbid obesity. Exp Mol Pathol. 2015 Jan 15; 98(2):178-183.

• Velazquez-Cruz R, Jimenez-Ortega RF, Parra-Torres AY, Castillejos-Lopez M, Patino N, Quiterio M, Villarreal-Molina T, Salmeron J. Analysis of association of MEF2C, SOST and JAG1 genes with bone mineral density in Mexican-Mestizo postmenopausal women.. BMC Musculoskelet Disord. 2014 Nov 28; 15:400.

• Larrieta-Carrasco E, Acuna-Alonzo V, Velazquez-Cruz R, Barquera-Lozano R, Leon-Mimila P, Villamil-Ramirez H, Menjivar M, Romero-Hidalgo S, Mendez-Sanchez N, Cardenas V, Banuelos-Moreno M, Flores YN, Quiterio M, Salmeron J, Sanchez-Munoz F, Villarreal-Molina T, Aguilar-Salinas CA, Canizales-Quinteros S. PNPLA3 I148M polymorphism is associated with elevated alanine transaminase levels in Mexican Indigenous and Mestizo populations. Mol Biol Rep. 2014 Apr 2; 41(7):4705-11.

• Velazquez-Cruz R, Garcia-Ortiz H, Castillejos-Lopez M, Quiterio M, Valdes-Flores M, Orozco L, Villarreal-Molina T, Salmeron J. WNT3A gene polymorphisms are associated with bone mineral density variation in postmenopausal mestizo women of an urban Mexican population: findings of a pathway-based high-density single nucleotide screening. Age (Dordr). 2014 Mar 3; 36(3):9635.

• Torres-Espindola LM, Velazquez-Cruz R, Falfan-Valencia R, Chavez-Pacheco JL, Salcedo-Vargas M, Nambo-Lucio MD, Salinas-Lara C, Alemon-Medina R, Granados-Montiel J, Reyes-Servin MA, Granados J, Castillejos-Lopez MD. Genetic polymorphism of the TNF promoter region and the susceptibility to develop Hodgkin's lymphoma in a Mexican population. Leuk Lymphoma. 2013 Sep 16; 55(6):1295-9.

• Torres Espindola LM, Arellano Galindo J, Velazquez Cruz R, Castillejos Lopez Mde J. Factores que participan en la interaccion huesped-agente patogeno en el riesgo de Linfoma de Hodgkin inducido por el virus Epstein Barr.. Invest Clin. 2013 Sep; 54(3):311-24.

• Falcon-Ramirez E, Casas-Avila L, Cerda-Flores RM, Castro-Hernandez C, Rubio-Lightbourn J, Velazquez-Cruz R, Diez-G P, Penaloza-Espinosa R, Valdes-Flores M. Association of LRP5 haplotypes with osteoporosis in Mexican women. Mol Biol Rep. 2012 Dec 16; 40:2705-2710.

• Ramirez-Bello J, Jimenez-Morales S, Espinosa-Rosales F, Gomez-Vera J, Gutierrez A, Velazquez Cruz R, Baca V, Orozco L. Juvenile rheumatoid arthritis and asthma, but not childhood-onset systemic lupus erythematosus are associated with FCRL3 polymorphisms in Mexicans. Mol Immunol. 2013 Apr; 53(4):374-8.

• Jimenez-Morales S, Gamboa-Becerra R, Baca V, Del Rio-Navarro BE, Lopez-Ley DY, Velazquez-Cruz R, Saldana-Alvarez Y, Salas-Martinez G, Orozco L. MiR-146a polymorphism is associated with asthma but not with systemic lupus erythematosus and juvenile rheumatoid arthritis in Mexican patients. Tissue Antigens. 2012 Jul 24; 80(4):317-21.

• Velazquez-Cruz R, Jimenez-Morales S, Ramirez-Bello J, Aguilar-Delfin I, Salas-Martinez G, Baca Ruiz V, Orozco Orozco L. Lupus eritematoso sistemico (LES): genomica de la enfermedad. Gac Med Mex. 2012 Jul-Aug; 148(4):371-80.

• Cordova EJ, Martinez-Hernandez A, Ramirez-Bello J, Velazquez-Cruz R, Centeno F, Baca V, Orozco L. HMOX1 promoter (GT)n polymorphim is associated with childhood-onset systemic lupus erythematosus but not with juvenile rheumatoid arthritis in a Mexican population. Clin Exp Rheumatol. 2012 Mar-Apr; 30(2):297-301.

• Saldana-Alvarez Y, Jimenez-Morales S, Echevarria-Sanchez M, Jimenez-Ruiz JL, Garcia-Cavazos R, Velazquez-Cruz R, Carnevale A, Orozco L. Molecular Screening of the CFTR Gene in Mexican Patients with Congenital Absence of the Vas Deferens. Genet Test Mol Biomarkers. 2012 Apr; 16(4):292-6.

• Agueda L, Velazquez-Cruz R, Urreizti R, Yoskovitz G, Sarrion P, Jurado S, Guerri R, Garcia-Giralt N, Nogues X, Mellibovsky L, Diez-Perez A, Marie PJ, Balcells S, Grinberg D. Functional relevance of the BMD-associated polymorphism rs312009: novel involvement of RUNX2 in LRP5 transcriptional regulation. J Bone Miner Res. 2011 May; 26(5):1133-44.

• Garcia-Ortiz H, Velazquez-Cruz R, Espinosa-Rosales F, Jimenez-Morales S, Baca V, Orozco L. Association of TLR7 copy number variation with susceptibility to childhood-onset systemic lupus erythematosus in Mexican population. Ann Rheum Dis. 2010 Oct; 69(10):1861-5.

• Cordova EJ, Velazquez-Cruz R, Centeno F, Baca V, Orozco L. The NRF2 gene variant, -653G/A, is associated with nephritis in childhood-onset systemic lupus erythematosus. Lupus. 2010 Sep; 19(10):1237-42.

• Jimenez-Morales S, Velazquez-Cruz R, Ramirez-Bello J, Bonilla-Gonzalez E, Romero-Hidalgo S, Escamilla-Guerrero G, Cuevas F, Espinosa-Rosales F, Martinez-Aguilar NE, Gomez-Vera J, Baca V, Orozco L. Tumor necrosis factor-alpha is a common genetic risk factor for asthma, juvenile rheumatoid arthritis, and systemic lupus erythematosus in a Mexican pediatric population. Hum Immunol. 2009 Apr; 70(4):251-6.

• Checa M, Ruiz V, Montano M, Velazquez-Cruz R, Selman M, Pardo A. MMP-1 polymorphisms and the risk of idiopathic pulmonary fibrosis. Hum Genet. 2008 Dec; 124(5):465-72.

• Abelson AK, Delgado-Vega AM, Kozyrev SV, Sanchez E, Velazquez-Cruz R, Eriksson N, Wojcik J, Linga Reddy MV, Lima G, D'Alfonso S, Migliaresi S, Baca V, Orozco L, Witte T, Ortego-Centeno N, Abderrahim H, Pons-Estel BA, Gutierrez C, Suarez A, Gonzalez-Escribano MF, Martin J, Alarcon-Riquelme ME. STAT4 associates with systemic lupus erythematosus through two independent effects that correlate with gene expression and act additively with IRF5 to increase risk. Ann Rheum Dis. 2008 Nov; 68(11):1746-53.

• Jimenez-Morales S, Miranda-Peralta E, Saldana-Alvarez Y, Perez-Vera P, Paredes-Aguilera R, Rivera-Luna R, Velazquez-Cruz R, Ramirez-Bello J, Carnevale A, Orozco L. BCR-ABL, ETV6-RUNX1 and E2A-PBX1: prevalence of the most common acute lymphoblastic leukemia fusion genes in Mexican patients. Leuk Res. 2008 Oct; 32(10):1518-22.

• Reddy MV, Velazquez-Cruz R, Baca V, Lima G, Granados J, Orozco L, Alarcon-Riquelme ME. Genetic association of IRF5 with SLE in Mexicans: higher frequency of the risk haplotype and its homozygozity than Europeans. Hum Genet. 2007 Jul; 121(6):721-7.

• Velazquez-Cruz R, Orozco L, Espinosa-Rosales F, Carreno-Manjarrez R, Solis-Vallejo E, Lopez-Lara ND, Ruiz-Lopez IK, Rodriguez-Lozano AL, Estrada-Gil JK, Jimenez-Sanchez G, Baca V. Association of PDCD1 polymorphisms with childhood-onset systemic lupus erythematosus. Eur J Hum Genet. 2007 Mar; 15(3):336-41.

• Baca V, Velazquez-Cruz R, Salas-Martinez G, Espinosa-Rosales F, Saldana-Alvarez Y, Orozco L. Association analysis of the PTPN22 gene in childhood-onset systemic lupus erythematosus in Mexican population. Genes Immun. 2006 Dec; 7(8):693-5.

En curso

• BUSQUEDA DE MARCADORES BIOLÓGICOS DEL REMODELADO ÓSEO PARA EL DIAGNÓSTICO DE LA OSTEOPOROSIS
• Caracterización de la composición y diversidad de la microbiota intestinal: impacto en la pérdida de la masa ósea y sus principales complicaciones.
• IDENTIFICACIÓN DE SNPS ASOCIADOS CON LOS NIVELES DE VITAMINA D, EN EL ESTUDIO DE COHORTE DE TRABAJADORES DE LA SALUD Y UN PANORAMA DE SU DISTRIBUCIÓN EN GRUPOS INDÍGENAS DE MÉXICO.
• Titina, su regulación por miRNAs y su relación con proteínas del citoesqueleto.

Terminados

• Análisis de expresión de microRNAs en suero de mujeres postmenopáusicas: búsqueda de biomarcadores no invasivos del metabolismo óseo para el diagnóstico de la osteoporosis
• Análisis de Haplotipos y prevalencia de la mutación c.1987delC en el Gen GAA causante de la enfermedad de Pompe en individuos de comunidades en aislamiento genético en la Zona Huasteca de San Luis Potosí
• Análisis de perfiles de expresión de miRNAs en pacientes con osteosarcoma y su potencial aplicación como herramienta de diagnóstico.
• Asociación de Polimorfismos en genes candidato con la susceptibilidad, gravedad y respuesta al tratamiento en población infantil mexicana con Asma
• Densidad mineral ósea y osteoporosis en mujeres mexicanas: estudio de asociación de genoma completo.
• Factores genéticos amerindios y variantes raras que contribuyen al desarrollo de la diabetes mellitus tipo 2 en familias indígenas rurales de la Cd. de México.
• Identificación de biomarcadores asociados a la variación de la Densidad Mineral Ósea mediante análisis de miRNAs en monocitos circulantes de sangre periférica en mujeres postmenopáusicas mexicanas.
• Identificación de microRNAs involucrados en la diferenciación de monocitos a osteoclastos y su papel en la variación de la densidad mineral Ósea.
• Identificación de proteínas del remodelado óseo como nuevos marcadores: análisis integrativo de proteómica y transcriptómica en osteoporosis.
• Impacto de factores genéticos y ambientales en la Susceptibilidad a Enfermedad Hepática en una cohorte de adultos mexicanos
• PARTICIPACIÓN DE LOS GENES DE LA CAPTACIÓN, SÍNTESIS Y BIOTRANSFORMACIÓN DEL COLESTEROL EN LA PROGRESIÓN DE ESTEATOSIS A ESTEATOHEPATITIS EN SUJETOS OBESOS
• Polimorfismos en genes candidatos y su asociación con lupus eritematoso sistémico de inicio en la edad pediátrica.
• Polimorfismos en genes de la ruta de señalización WNT y su asociación en la variación de la densidad mineral ósea (DMO) en pacientes con Osteoporosis