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Curriculum Vitae

Humberto García Ortiz

 Humberto García Ortiz

Investigador en Ciencias Médicas C
5350-1962 ext.1962
hgarcia@inmegen.gob.mx

Cursó la licenciatura en Química Farmacéutica Biológica en la Universidad Autónoma Metropolitana unidad Xochimilco; obtuvo el grado de Doctor en Ciencias Biomédicas con mención honorifica en la Facultad de Ciencias Biomédicas de la Universidad Nacional Autónoma de México, ha realizado diversas estancias de investigación, resaltando las hechas en el instituto BROAD de Harvard y el MIT. Actualmente es Investigador en Ciencias Médicas “C”, adscrito al Laboratorio de Inmunogenómica y Enfermedades Metabólicas del INMEGEN y es miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) Nivel I.

Desde 2012 colabora en las líneas de investigación Genómica de enfermedades metabólicas, Genómica de enfermedades autoinmunes, Genómica de poblaciones y Genómica del Microbioma, englobando proyectos dirigidos a entender las bases genéticas que contribuyen a la diversificación poblacional y que predisponen al desarrollo de las enfermedades más comunes en nuestro país, entre otros temas.

Estas líneas han tenido contribuciones importantes, tales como la identificación de un incremento en el número de copias del gen TLR7 que un confiere OR elevado (3.07) para el desarrollo de Lupus Eritematoso Sistémico (LES). También derivado de las investigaciones en diabetes y como parte de los consorcios SIGMA T2D, ha contribuido a la identificación genes que confieren riesgo para DT2 en la población mexicana, estos estudios sugieren que los genes SLC16A11 y HNF1A son factores de riesgo exclusivos de las poblaciones con ancestría nativa americana.
Ha publicado 17 artículos de investigación en revistas internacionales. Muchos de los resultados de las líneas mencionados se han publicado en revistas del más alto impacto, tales como Nature, Jama, Diabetes, Annals of the Rheumatic Diseases entre otras y cuenta con cerca de 1150 citas. Ha dirigido 5 tesis, que incluyen 3 de especialidad y 2 de licenciatura. Ha recibido 2 premios y distinciones como becario del CONACyT y de la fundación Carlos Slim para la Salud. Destaca el Premio Nacional de Investigación “Fundación GSK-FUNSALUD 2014” al mejor trabajo de investigación en el área clínica.

Artículos

  • Mirzaeicheshmeh E, Zerrweck C, Centeno-Cruz F, Baca-Peynado P, Martinez-Hernandez A, Garcia-Ortiz H, Contreras-Cubas C, Salas-Martinez MG, Saldana-Alvarez Y, Mendoza-Caamal EC, Barajas-Olmos F, Orozco L. Alterations of DNA methylation during adipogenesis differentiation of mesenchymal stem cells isolated from adipose tissue of patients with obesity is associated with type 2 diabetes. Adipocyte. 2021 Dec; 10(1):493-504.

  • Morales-Rivera MI, Alemon-Medina R, Martinez-Hernandez A, Gomez-Garduno J, Mirzaeicheshmeh E, Altamirano-Bustamante NF, Ilizaliturri-Flores I, Mendoza-Caamal EC, Perez-Guille MG, Garcia-Alvarez R, Contreras-Cubas C, Centeno-Cruz F, Revilla-Monsalve C, Garcia-Ortiz H, Barajas-Olmos F, Orozco L. The L125F MATE1 variant enriched in populations of Amerindian origin is associated with increased plasma levels of metformin and lactate. Biomed Pharmacother. 2021 Oct; 142:112009.

  • Mendoza-Caamal EC, Barajas-Olmos F, Mirzaeicheshmeh E, Ilizaliturri-Flores I, Aguilar-Salinas CA, Gomez-Velasco DV, Ciceron-Arellano I, Resendiz-Rodriguez A, Martinez-Hernandez A, Contreras-Cubas C, Islas-Andrade S, Zerrweck C, Garcia-Ortiz H, Orozco L. Two novel variants in DYRK1B causative of AOMS3: expanding the clinical spectrum. Orphanet J Rare Dis. 2021 Jun 30; 16(1):291.

  • Goodrich JK, Singer-Berk M, Son R, Sveden A, Wood J, England E, Cole JB, Weisburd B, Watts N, Caulkins L, Dornbos P, Koesterer R, Zappala Z, Zhang H, Maloney KA, Dahl A, Aguilar-Salinas CA, Atzmon G, Barajas-Olmos F, Barzilai N, Blangero J, Boerwinkle E, Bonnycastle LL, Bottinger E, Bowden DW, Centeno-Cruz F, Chambers JC, Chami N, Chan E, Chan J, Cheng CY, Cho YS, Contreras-Cubas C, Cordova E, Correa A, DeFronzo RA, Duggirala R, Dupuis J, Garay-Sevilla ME, Garcia-Ortiz H, Gieger C, Glaser B, Gonzalez-Villalpando C, Gonzalez ME, Grarup N, Groop L, Gross M, Haiman C, Han S, Hanis CL, Hansen T, Heard-Costa NL, Henderson BE, Hernandez JMM, Hwang MY, Islas-Andrade S, Jorgensen ME, Kang HM, Kim BJ, Kim YJ, Koistinen HA, Kooner JS, Kuusisto J, Kwak SH, Laakso M, Lange L, Lee JY, Lee J, Lehman DM, Linneberg A, Liu J, Loos RJF, Lyssenko V, Ma RCW, Martinez-Hernandez A, Meigs JB, Meitinger T, Mendoza-Caamal E, Mohlke KL, Morris AD, Morrison AC, Ng MCY, Nilsson PM, O'Donnell CJ, Orozco L, Palmer CNA, Park KS, Post WS, Pedersen O, Preuss M, Psaty BM, Reiner AP, Revilla-Monsalve C, Rich SS, Rotter JI, Saleheen D, Schurmann C, Sim X, Sladek R, Small KS, So WY, Spector TD, Strauch K, Strom TM, Tai ES, Tam CHT, Teo YY, Thameem F, Tomlinson B, Tracy RP, Tuomi T, Tuomilehto J, Tusie-Luna T, van Dam RM, Vasan RS, Wilson JG, Witte DR, Wong TY, Burtt NP, Zaitlen N, McCarthy MI, Boehnke M, Pollin TI, Flannick J, Mercader JM, O'Donnell-Luria A, Baxter S, Florez JC, MacArthur DG, Udler MS. Determinants of penetrance and variable expressivity in monogenic metabolic conditions across 77,184 exomes. Nat Commun. 2021 Jun 9; 12(1):3505.

  • Wibowo MC, Yang Z, Borry M, Hubner A, Huang KD, Tierney BT, Zimmerman S, Barajas-Olmos F, Contreras-Cubas C, Garcia-Ortiz H, Martinez-Hernandez A, Luber JM, Kirstahler P, Blohm T, Smiley FE, Arnold R, Ballal SA, Pamp SJ, Russ J, Maixner F, Rota-Stabelli O, Segata N, Reinhard K, Orozco L, Warinner C, Snow M, LeBlanc S, Kostic AD. Reconstruction of ancient microbial genomes from the human gut. Nature. 2021 Jun; 594(7862):234-239.

  • Aguilar-Ordonez I, Perez-Villatoro F, Garcia-Ortiz H, Barajas-Olmos F, Ballesteros-Villascan J, Gonzalez-Buenfil R, Fresno C, Garciarrubio A, Fernandez-Lopez JC, Tovar H, Hernandez-Lemus E, Orozco L, Soberon X, Morett E. Whole genome variation in 27 Mexican indigenous populations, demographic and biomedical insights. PLoS One. 2021; 16(4):e0249773.

  • Mendoza-Caamal EC, Barajas-Olmos F, Garcia-Ortiz H, Ciceron-Arellano I, Martinez-Hernandez A, Cordova EJ, Esparza-Aguilar M, Contreras-Cubas C, Centeno-Cruz F, Cid-Soto M, Morales-Marin ME, Resendiz-Rodriguez A, Jimenez-Ruiz JL, Salas-Martinez MG, Saldana-Alvarez Y, Mirzaeicheshmeh E, Rojas-Martinez MR, Orozco L. Metabolic syndrome in indigenous communities in Mexico: a descriptive and cross-sectional study. BMC Public Health. 2020 Mar 17; 20(1):339.

  • Salas-Martinez MG, Saldana-Alvarez Y, Cordova EJ, Mendiola-Soto DK, Cid-Soto MA, Luckie-Duque A, Vicenteno-Ayala H, Barajas-Olmos F, Contreras-Cubas C, Garcia-Ortiz H, Jimenez-Ruiz JL, Centeno-Cruz F, Martinez-Hernandez A, Mendoza-Caamal EC, Mirzaeicheshmeh E, Orozco L. Genetic variability of five ADRB2 polymorphisms among Mexican Amerindian ethnicities and the Mestizo population. PLoS One. 2019; 14(12):e0225030.

  • Gonzalez-Covarrubias V, Morales-Franco M, Cruz-Correa OF, Martinez-Hernandez A, Garcia-Ortiz H, Barajas-Olmos F, Genis-Mendoza AD, Martinez-Magana JJ, Nicolini H, Orozco L, Soberon X. Variation in Actionable Pharmacogenetic Markers in Natives and Mestizos From Mexico. Front Pharmacol. 2019; 10:1169.

  • Martinez-Magana JJ, Genis-Mendoza AD, Tovilla-Zarate CA, Gonzalez-Castro TB, Juarez-Rojop IE, Hernandez-Diaz Y, Martinez-Hernandez AG, Garcia-Ortiz H, Orozco L, Lopez-Narvaez ML, Nicolini H. Association between APOE polymorphisms and lipid profile in Mexican Amerindian population. Mol Genet Genomic Med. 2019 Nov; 7(11):e958.

  • Contreras-Cubas C, Garcia-Ortiz H, Velazquez-Cruz R, Barajas-Olmos F, Baca P, Martinez-Hernandez A, Barbosa-Cobos RE, Ramirez-Bello J, Lopez-Hernandez MA, Svyryd Y, Mutchinick OM, Baca V, Orozco L. Catalytically Impaired TYK2 Variants are Protective Against Childhood- and Adult-Onset Systemic Lupus Erythematosus in Mexicans. Sci Rep. 2019 Aug 21; 9(1):12165.

  • Flannick J, Mercader JM, Fuchsberger C, Udler MS, Mahajan A, Wessel J, Teslovich TM, Caulkins L, Koesterer R, Barajas-Olmos F, Blackwell TW, Boerwinkle E, Brody JA, Centeno-Cruz F, Chen L, Chen S, Contreras-Cubas C, Cordova E, Correa A, Cortes M, DeFronzo RA, Dolan L, Drews KL, Elliott A, Floyd JS, Gabriel S, Garay-Sevilla ME, Garcia-Ortiz H, Gross M, Han S, Heard-Costa NL, Jackson AU, Jorgensen ME, Kang HM, Kelsey M, Kim BJ, Koistinen HA, Kuusisto J, Leader JB, Linneberg A, Liu CT, Liu J, Lyssenko V, Manning AK, Marcketta A, Malacara-Hernandez JM, Martinez-Hernandez A, Matsuo K, Mayer-Davis E, Mendoza-Caamal E, Mohlke KL, Morrison AC, Ndungu A, Ng MCY, O'Dushlaine C, Payne AJ, Pihoker C, Post WS, Preuss M, Psaty BM, Vasan RS, Rayner NW, Reiner AP, Revilla-Monsalve C, Robertson NR, Santoro N, Schurmann C, So WY, Soberon X, Stringham HM, Strom TM, Tam CHT, Thameem F, Tomlinson B, Torres JM, Tracy RP, van Dam RM, Vujkovic M, Wang S, Welch RP, Witte DR, Wong TY, Atzmon G, Barzilai N, Blangero J, Bonnycastle LL, Bowden DW, Chambers JC, Chan E, Cheng CY, Cho YS, Collins FS, de Vries PS, Duggirala R, Glaser B, Gonzalez C, Gonzalez ME, Groop L, Kooner JS, Kwak SH, Laakso M, Lehman DM, Nilsson P, Spector TD, Tai ES, Tuomi T, Tuomilehto J, Wilson JG, Aguilar-Salinas CA, Bottinger E, Burke B, Carey DJ, Chan JCN, Dupuis J, Frossard P, Heckbert SR, Hwang MY, Kim YJ, Kirchner HL, Lee JY, Lee J, Loos RJF, Ma RCW, Morris AD, O'Donnell CJ, Palmer CNA, Pankow J, Park KS, Rasheed A, Saleheen D, Sim X, Small KS, Teo YY, Haiman C, Hanis CL, Henderson BE, Orozco L, Tusie-Luna T, Dewey FE, Baras A, Gieger C, Meitinger T, Strauch K, Lange L, Grarup N, Hansen T, Pedersen O, Zeitler P, Dabelea D, Abecasis G, Bell GI, Cox NJ, Seielstad M, Sladek R, Meigs JB, Rich SS, Rotter JI, Altshuler D, Burtt NP, Scott LJ, Morris AP, Florez JC, McCarthy MI, Boehnke M. Exome sequencing of 20,791 cases of type 2 diabetes and 24,440 controls. Nature. 2019 Jun; 570(7759):71-76.

  • Martinez-Hernandez A, Larrosa J, Barajas-Olmos F, Garcia-Ortiz H, Mendoza-Caamal EC, Contreras-Cubas C, Mirzaeicheshmeh E, Lezana JL, Orozco L. Next-generation sequencing for identifying a novel/de novo pathogenic variant in a Mexican patient with cystic fibrosis: a case report. BMC Med Genomics. 2019 May 22; 12(1):68.

  • Reynolds AW, Mata-Miguez J, Miro-Herrans A, Briggs-Cloud M, Sylestine A, Barajas-Olmos F, Garcia-Ortiz H, Rzhetskaya M, Orozco L, Raff JA, Hayes MG, Bolnick DA. Comparing signals of natural selection between three Indigenous North American populations. Proc Natl Acad Sci USA. 2019 Apr 15; 116:.

  • Berumen J, Orozco L, Betancourt-Cravioto M, Gallardo H, Zulueta M, Mendizabal L, Simon L, Benuto RE, Ramirez-Campos E, Marin M, Juarez E, Garcia-Ortiz H, Martinez-Hernandez A, Venegas-Vega C, Peralta-Romero J, Cruz M, Tapia-Conyer R. Influence of obesity, parental history of diabetes, and genes in type 2 diabetes: A case-control study. Sci Rep. 2019 Feb 26; 9(1):2748.

  • Boisson-Dupuis S, Ramirez-Alejo N, Li Z, Patin E, Rao G, Kerner G, Lim CK, Krementsov DN, Hernandez N, Ma CS, Zhang Q, Markle J, Martinez-Barricarte R, Payne K, Fisch R, Deswarte C, Halpern J, Bouaziz M, Mulwa J, Sivanesan D, Lazarov T, Naves R, Garcia P, Itan Y, Boisson B, Checchi A, Jabot-Hanin F, Cobat A, Guennoun A, Jackson CC, Pekcan S, Caliskaner Z, Inostroza J, Costa-Carvalho BT, de Albuquerque JAT, Garcia-Ortiz H, Orozco L, Ozcelik T, Abid A, Rhorfi IA, Souhi H, Amrani HN, Zegmout A, Geissmann F, Michnick SW, Muller-Fleckenstein I, Fleckenstein B, Puel A, Ciancanelli MJ, Marr N, Abolhassani H, Balcells ME, Condino-Neto A, Strickler A, Abarca K, Teuscher C, Ochs HD, Reisli I, Sayar EH, El-Baghdadi J, Bustamante J, Hammarstrom L, Tangye SG, Pellegrini S, Quintana-Murci L, Abel L, Casanova JL. Tuberculosis and impaired IL-23-dependent IFN-gamma immunity in humans homozygous for a common TYK2 missense variant. Sci Immunol. 2018 Dec 21; 3(30):.

  • Cid-Soto MA, Martinez-Hernandez A, Garcia-Ortiz H, Cordova EJ, Barajas-Olmos F, Centeno-Cruz F, Contreras-Cubas C, Mendoza-Caamal EC, Ciceron-Arellano I, Morales-Rivera MI, Jimenez-Ruiz JL, Salas-Martinez G, Saldana-Alvarez Y, Revilla-Monsalve C, Islas-Andrade S, Orozco L. Gene variants in AKT1, GCKR and SOCS3 are differentially associated with metabolic traits in Mexican Amerindians and Mestizos. Gene. 2018 Dec 30; 679:160-171.

  • Romero-Hidalgo S, Ochoa-Leyva A, Garciarrubio A, Acuna-Alonzo V, Antunez-Arguelles E, Balcazar-Quintero M, Barquera-Lozano R, Carnevale A, Cornejo-Granados F, Fernandez-Lopez JC, Garcia-Herrera R, Garcia-Ortiz H, Granados-Silvestre A, Granados J, Guerrero-Romero F, Hernandez-Lemus E, Leon-Mimila P, Macin-Perez G, Martinez-Hernandez A, Menjivar M, Morett E, Orozco L, Ortiz-Lopez G, Perez-Villatoro F, Rivera-Morales J, Riveros-McKay F, Villalobos-Comparan M, Villamil-Ramirez H, Villarreal-Molina T, Canizales-Quinteros S, Soberon X. Demographic history and biologically relevant genetic variation of Native Mexicans inferred from whole-genome sequencing. Nat Commun. 2017 Oct 18; 8(1):1005.

  • Mercader JM, Liao RG, Bell AD, Dymek Z, Estrada K, Tukiainen T, Huerta-Chagoya A, Moreno-Macias H, Jablonski KA, Hanson RL, Walford GA, Moran I, Chen L, Agarwala V, Ordonez-Sanchez ML, Rodriguez-Guillen R, Rodriguez-Torres M, Segura-Kato Y, Garcia-Ortiz H, Centeno-Cruz F, Barajas-Olmos F, Caulkins L, Puppala S, Fontanillas P, Williams AL, Bonas-Guarch S, Hartl C, Ripke S, Tooley K, Lane J, Zerrweck C, Martinez-Hernandez A, Cordova EJ, Mendoza-Caamal E, Contreras-Cubas C, Gonzalez-Villalpando ME, Cruz-Bautista I, Munoz-Hernandez L, Gomez-Velasco D, Alvirde U, Henderson BE, Wilkens LR, Le Marchand L, Arellano-Campos O, Riba L, Harden M, Gabriel S, Abboud HE, Cortes ML, Revilla-Monsalve C, Islas-Andrade S, Soberon X, Curran JE, Jenkinson CP, DeFronzo RA, Lehman DM, Hanis CL, Bell GI, Boehnke M, Blangero J, Duggirala R, Saxena R, MacArthur D, Ferrer J, McCarroll SA, Torrents D, Knowler WC, Baier LJ, Burtt N, Gonzalez-Villalpando C, Haiman CA, Aguilar-Salinas CA, Tusie-Luna T, Flannick J, Jacobs SBR, Orozco L, Altshuler D, Florez JC. A Loss-of-Function Splice Acceptor Variant in IGF2 Is Protective for Type 2 Diabetes. Diabetes. 2017 Nov; 66(11):2903-2914.

En curso

Terminados

  • Caracterización de variabilidad genética en población indígena mexicana (100G-MX)
  • Identificación de variantes funcionales en genes candidato asociados con el riesgo al desarrollo de síndrome metabólico en grupos indígenas y población mestiza mexicana
  • Perfil inmunogenético en pacientes diagnosticados con espectro autista de origen mexicano
  • PROYECTO DE CONTINUIDAD: ANÁLISIS DE VARIANTES GÉNICAS ASOCIADAS A DIABETES EN LA POBLACIÓN INDÍGENA MEXICANA.
  • Tamizaje inmunogenético en pacientes con Trastorno Bipolar

Ha colaborado en proyectos y/o publicaciones con:

Dra. Cecilia Contreras Cubas
Número de colaboraciones: 4
Dr. Emilio Joaquín Cordova Alarcón
Número de colaboraciones: 2
Dra. Alma Delia Genis Mendoza
Número de colaboraciones: 2
M. en C. Maria Guadalupe Salas Martinez
Número de colaboraciones: 2


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